Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	ACSS3	Gene	0	5.30	9.04	5.48	3.86	1.40	12.74	3.02	0.87	4.27	16.39	5.46	3.63	3.16	9.39	3.24	5.90	9.69	10.67	6.29	5.28	5.92	4.18	8.76	20.98	11.54	7.16	9.67	1.04	8.05
2	261206	Transcript	0	7.05	10.36	7.48	3.82	1.93	14.14	3.07	1.12	4.19	19.07	5.85	4.05	3.75	10.90	3.63	7.48	12.69	11.02	6.12	5.60	7.53	4.99	11.35	23.29	15.68	7.09	11.51	1.50	7.18
3	ER1a	ExonRegion	0	3.77	0.82	2.34	0.91	0.04	3.70	0.51	0.00	0.50	6.85	1.43	1.64	0.64	4.98	0.00	0.76	2.72	5.86	0.53	2.27	1.16	0.93	3.95	6.60	4.66	6.42	2.18	0.83	6.27
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	5.43	0.00	9.19	0.00	0.00	3.80	0.00	0.00	0.00	10.51	1.61	0.00	1.97	13.76	0.00	3.82	1.33	9.25	8.09	10.42	2.01	3.89	12.95	23.63	8.87	1.80	7.90	4.58	5.35
5	ER2a	ExonRegion	0	6.00	5.41	7.48	7.56	1.61	9.24	1.42	0.65	0.59	18.14	5.66	4.84	2.59	14.85	2.28	5.17	8.85	11.41	0.78	9.81	6.80	3.77	11.10	19.70	16.85	7.18	10.72	1.56	4.50
6	E2a_E3a	KnownJunction	0	5.66	0.00	8.52	0.00	0.00	13.81	0.00	0.00	0.00	12.78	0.00	3.01	3.41	11.12	7.97	9.79	12.76	9.25	0.00	7.61	5.54	0.00	2.51	11.36	23.64	1.89	10.14	8.54	6.67
7	ER3a	ExonRegion	0	6.59	6.34	7.78	0.08	0.03	13.26	4.35	0.50	0.45	21.48	6.84	5.39	3.90	14.53	2.07	7.65	13.56	19.96	3.45	6.57	7.34	8.34	16.76	17.60	22.38	9.82	8.75	1.54	9.80
8	E3a_E4a	KnownJunction	0	5.01	12.99	10.96	0.00	0.00	15.19	0.00	0.00	0.00	28.84	8.86	11.99	5.80	9.68	0.00	6.88	15.64	27.87	0.00	3.72	3.65	8.80	29.70	19.50	20.87	3.43	20.87	1.89	0.00
9	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	3.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER4a	ExonRegion	0	8.02	14.53	10.23	5.31	3.65	15.81	4.57	2.09	0.24	25.95	9.78	6.09	4.09	11.76	3.36	7.50	18.85	20.88	1.01	6.54	7.25	7.28	16.44	26.85	19.63	9.88	10.56	3.24	9.40
11	E4a_E5a	KnownJunction	0	4.90	7.85	7.65	0.00	5.45	13.58	0.00	0.00	1.52	8.63	0.00	4.19	0.00	5.69	0.00	5.58	9.88	9.25	8.09	2.98	4.85	1.85	6.75	19.14	14.66	0.00	0.00	2.29	3.40
12	ER5a	ExonRegion	0	9.59	14.00	8.00	5.19	0.92	14.64	0.00	1.33	0.18	21.51	6.64	5.71	2.53	9.68	1.67	2.69	11.67	9.64	2.92	4.09	5.24	4.09	12.17	24.58	13.18	5.89	7.88	0.29	13.94
13	E5a_E6a	KnownJunction	0	5.19	21.81	7.15	0.00	7.37	13.16	0.00	0.00	0.00	13.10	8.32	4.76	0.00	8.26	0.00	3.82	14.92	18.49	8.09	0.00	15.80	4.76	2.07	30.51	10.30	6.27	2.53	0.00	6.50
14	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	25.31	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER6a	ExonRegion	0	5.32	8.03	7.85	0.00	1.48	8.37	2.69	0.00	2.33	14.47	2.98	2.79	1.92	11.79	0.00	6.87	12.75	6.50	1.62	9.54	6.57	4.74	6.83	23.53	11.51	2.97	16.62	0.00	5.67
16	E6a_E7a	KnownJunction	0	5.25	4.46	8.60	0.00	0.00	6.64	0.00	0.00	6.00	14.02	3.73	1.20	6.62	6.87	0.00	0.00	13.87	0.00	0.00	0.00	5.46	4.38	6.85	29.73	15.61	10.47	12.37	0.00	12.18
17	ER7a	ExonRegion	0	8.13	15.71	7.82	3.81	4.62	17.44	2.83	0.00	1.60	15.39	2.38	1.55	3.27	11.52	0.00	2.64	11.48	9.61	5.23	3.48	6.58	5.18	6.23	26.55	15.68	9.43	16.01	0.00	15.73
18	E7a_E8a	KnownJunction	0	4.78	0.00	4.26	0.00	6.19	16.27	2.46	0.00	1.71	10.87	6.45	0.00	7.93	11.41	0.00	0.00	6.05	19.01	8.09	11.99	15.24	4.62	6.55	23.27	16.10	5.97	16.30	0.00	4.69
19	ER8a	ExonRegion	0	7.36	6.94	5.29	4.81	2.00	11.64	3.45	1.13	4.12	13.25	4.69	4.04	2.71	10.71	2.62	3.93	12.70	9.21	1.88	4.75	6.28	3.53	8.68	20.27	12.02	10.63	9.00	0.55	4.63
20	E8_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E8a_E9a	KnownJunction	0	7.90	9.21	6.33	0.00	0.00	17.57	5.84	2.24	1.77	11.42	0.00	4.01	10.73	12.67	9.97	15.91	10.51	9.76	0.00	7.77	1.52	4.47	8.72	10.71	15.19	8.41	2.53	0.00	3.47
22	I8_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER9a	ExonRegion	0	6.62	6.13	8.57	3.52	0.00	13.23	5.08	2.02	2.47	19.07	6.97	3.31	4.85	12.05	1.56	10.15	10.29	9.71	4.09	6.16	6.49	4.97	12.83	23.08	15.70	16.26	12.43	0.80	4.14
24	E9a_E10a	KnownJunction	0	14.51	8.73	2.34	0.00	0.00	6.64	0.00	0.00	2.44	14.02	8.41	3.13	0.00	13.16	0.00	0.00	11.66	4.62	8.09	4.05	10.03	6.90	9.60	14.54	12.27	6.01	16.65	0.00	7.20
25	ER10a	ExonRegion	0	9.11	16.73	3.49	0.00	2.59	15.04	1.51	3.85	4.60	12.99	4.97	7.41	6.67	12.81	0.00	14.39	17.15	8.64	11.88	7.38	10.76	6.85	13.79	13.67	19.13	5.45	7.02	2.33	5.33
26	E10a_E11a	KnownJunction	0	5.49	17.16	7.08	0.00	0.00	20.22	7.32	0.00	6.70	17.06	1.42	6.17	4.27	13.01	0.00	17.67	21.25	9.25	24.28	4.05	9.63	4.38	21.28	6.94	34.36	5.28	14.46	4.22	1.68
27	ER11a	ExonRegion	0	8.24	7.96	7.24	0.00	0.39	10.91	9.07	2.50	6.27	16.17	2.44	3.05	3.29	9.64	3.68	11.70	15.29	12.28	3.54	5.40	9.07	2.28	13.70	23.83	22.60	11.30	10.79	0.59	3.59
28	E11a_E12a	KnownJunction	0	10.56	7.95	4.96	0.00	0.00	12.16	10.87	7.61	11.33	16.70	4.84	2.92	4.43	12.45	0.00	7.57	8.55	0.00	0.00	3.39	9.51	4.76	8.96	23.99	9.09	9.91	3.93	0.00	7.33
29	ER12a	ExonRegion	0	8.00	16.54	6.58	5.97	2.73	14.47	3.69	1.48	9.29	15.92	6.28	3.94	3.71	10.74	0.41	7.90	10.53	9.95	13.25	5.35	12.26	2.35	11.58	19.31	18.67	5.23	10.97	2.19	6.30
30	E12a_E13a	KnownJunction	0	16.04	29.96	11.36	17.69	0.00	14.81	0.00	0.00	8.19	24.09	17.27	8.46	3.57	10.26	0.00	14.99	13.26	9.25	8.09	3.64	13.20	0.00	15.46	13.94	16.90	7.55	20.67	1.84	0.00
31	ER13a	ExonRegion	0	5.84	12.55	8.95	11.41	2.03	11.99	6.69	0.00	7.62	18.90	13.87	4.22	3.99	14.38	10.61	8.56	15.89	13.93	5.74	6.54	10.55	4.27	12.66	27.48	16.69	4.40	18.99	1.15	10.90
32	E13a_E14a	KnownJunction	0	10.15	18.61	10.39	8.63	0.00	11.47	5.21	0.00	2.80	25.17	1.61	3.10	4.01	12.34	26.71	3.14	22.73	14.64	0.00	11.91	1.72	0.00	11.23	21.53	12.73	3.82	17.84	0.00	15.88
33	E14_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER14a	ExonRegion	0	8.57	14.36	9.92	3.00	1.64	21.57	2.68	1.53	6.94	31.85	10.81	5.29	5.13	10.71	8.06	12.32	19.89	9.03	6.74	6.10	7.00	6.11	17.85	35.39	14.94	12.90	16.74	1.19	11.46
35	E14_Da	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E14a_E15a	KnownJunction	0	2.77	12.12	5.33	0.00	7.07	23.52	5.09	4.93	15.62	45.26	11.86	4.64	3.18	9.55	16.74	10.10	17.17	9.25	0.00	4.13	7.58	8.61	14.18	65.44	18.68	5.92	0.00	1.84	12.61
37	ER15a	ExonRegion	0	5.55	9.91	9.87	6.81	1.16	20.75	4.46	2.33	7.03	30.28	12.14	4.24	3.17	11.09	10.98	11.58	15.34	11.03	10.80	5.35	9.62	9.26	12.87	35.53	12.86	10.94	12.69	2.21	13.59
38	E15a_E16a	KnownJunction	0	5.84	4.85	13.93	29.55	7.37	33.65	2.46	0.00	10.29	43.22	5.22	1.66	4.36	9.93	0.00	14.08	11.57	13.87	32.37	3.80	10.15	20.27	13.79	42.53	14.51	9.96	30.17	2.20	3.07
39	ER16a	ExonRegion	0	2.51	9.64	2.51	4.14	1.45	13.72	3.01	0.40	7.21	13.36	3.85	2.79	3.37	6.50	3.75	4.70	5.27	10.08	11.04	4.91	4.55	3.10	3.90	21.30	5.72	4.43	9.14	0.60	7.31
40	IG9	Intergenic	0	1.19	2.13	0.23	0.86	0.29	2.66	0.24	0.03	1.59	1.93	0.62	0.73	0.97	1.14	0.92	1.34	1.32	2.33	1.58	0.79	1.56	0.46	0.73	6.23	1.14	1.11	1.95	0.17	0.82
41	IG9_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	2.59	5.76	0.86	2.06	0.28	7.50	0.35	0.11	5.41	5.22	2.26	1.81	2.16	2.54	0.85	2.99	3.23	5.14	4.22	2.90	4.01	1.24	1.77	13.31	3.04	2.53	2.42	0.09	2.34
42	IG9_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.64	0.10	0.00	0.00	1.34	0.00	0.29	0.69	0.97	0.00	2.00	1.07	1.82	2.69	0.00	0.00	0.00	0.84	4.36	0.33	1.46	1.65	0.00	0.00
43	IG9_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	2.58	0.00	0.00	0.00	1.77	0.64	0.00	0.38	0.49	0.00	0.42	1.18	0.81	1.77	1.00	0.54	1.53	1.59	0.00	0.65	0.00	0.20	3.79	0.81	1.07	2.52	0.00	0.45
44	IG9_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	1.16	0.54	0.00	0.73	0.49	0.79	0.14	0.00	0.25	0.93	0.08	0.36	0.31	0.57	0.19	0.59	0.66	1.30	0.22	0.07	0.96	0.18	0.43	4.13	0.39	0.48	1.83	0.33	0.34