Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC007688.1	Gene	0	2.91	3.57	6.41	20.94	9.57	2.02	9.66	0.52	3.44	8.02	1.64	0.69	0.70	1.13	26.71	7.85	15.80	4.85	1.02	6.83	1.11	0.58	0.45	4.08	0.90	0.76	1.83	0.36	0.49
2	499948	Transcript	0	2.31	3.13	7.85	33.18	11.30	0.77	15.78	0.27	2.79	6.74	0.60	0.62	0.92	0.69	39.48	4.85	11.36	4.80	0.65	8.05	0.28	0.59	0.45	2.21	0.80	0.65	1.06	0.18	0.19
3	500905	Transcript	0	0.94	0.97	1.45	1.46	1.57	1.08	0.68	0.16	0.59	2.91	1.01	0.22	0.04	0.48	4.86	3.63	6.06	2.04	0.44	0.64	0.99	0.15	0.14	1.37	0.35	0.15	0.61	0.19	0.38
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.27	0.00	0.89	0.29	0.34	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	1.69	0.00	0.00	0.00	5.83	0.00	0.00	0.00	1.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.00	1.33	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	1.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.62
8	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.42	0.00	1.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00	0.63
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	8.34	0.00	0.00	11.20	0.00	4.58	0.00	0.00	1.76	0.00	1.42	0.00	1.13	0.00	0.00	3.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.63	0.00	0.00	0.00	1.72
10	ER2a	ExonRegion	0	8.09	11.08	29.07	138.18	45.11	1.97	41.25	0.24	6.99	27.42	2.17	2.40	3.25	2.24	185.43	18.24	37.81	9.66	2.49	28.09	0.37	2.35	1.88	4.76	3.53	1.84	2.38	0.64	0.61
11	E2_Da	NovelBoundary	0	5.31	4.17	5.66	10.35	0.00	1.96	22.03	2.19	4.05	11.26	0.00	2.59	5.03	0.00	178.39	13.54	19.16	0.00	0.00	2.89	1.97	0.00	0.00	5.98	1.67	4.38	0.00	0.00	0.00
12	E2a_E4b	KnownJunction	0	0.00	0.00	3.91	8.20	0.00	0.00	22.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.03	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix	Intron	0	2.30	6.90	6.09	35.33	6.28	1.18	8.63	0.00	1.20	8.04	1.02	0.66	0.00	1.45	52.05	4.25	7.36	1.24	2.05	6.50	0.00	0.77	0.00	0.92	2.45	0.00	0.00	0.35	0.00
14	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.99	9.12	8.15	49.38	8.79	1.24	11.54	0.00	1.68	11.21	1.43	0.92	0.00	1.60	72.51	5.88	9.28	1.73	2.88	9.08	0.00	1.08	0.00	0.72	3.00	0.00	0.00	0.49	0.00
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.58	1.39	0.95	0.22	0.00	1.06	1.40	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	1.11	0.85	0.19	2.63	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.47	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18
17	Ix	Intron	0	1.05	1.05	3.01	1.17	2.39	0.90	0.33	0.00	1.10	3.30	0.00	0.50	0.00	0.44	0.00	0.70	4.39	0.94	0.00	2.25	1.63	0.29	0.00	1.05	0.00	1.03	0.00	0.53	0.99
18	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.06	1.06	3.03	1.18	2.41	0.90	0.33	0.00	1.11	3.33	0.00	0.51	0.00	0.45	0.00	0.70	4.42	0.95	0.00	2.27	1.64	0.30	0.00	1.06	0.00	1.03	0.00	0.54	0.99
19	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.56	6.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.55	7.51	0.00	1.87	0.00	1.13	0.00	0.00	7.29	4.62	0.00	3.97	1.68	0.00	0.00	0.00	0.00	1.59	0.00	0.00	1.85
20	ER4a	ExonRegion	0	1.88	1.95	2.89	2.93	3.14	2.15	1.35	0.32	1.18	5.82	2.01	0.44	0.08	0.97	9.24	7.26	12.13	4.08	0.89	1.28	1.30	0.31	0.27	2.74	0.70	0.30	1.22	0.38	0.59
21	E4_Ab	KnownBoundary	0	0.00	4.85	1.32	42.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	8.95	0.00	0.00	0.00	0.00	34.08	14.69	11.28	9.25	0.00	8.27	1.56	0.00	0.00	5.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER4b	ExonRegion	0	2.10	2.64	8.10	20.73	7.70	2.13	21.38	0.00	4.58	10.79	1.52	0.57	0.96	0.48	25.87	11.98	17.34	4.75	2.24	5.24	0.85	0.00	0.00	9.51	0.75	0.00	2.27	0.00	0.00
23	E4_Da	KnownBoundary	0	2.24	9.70	11.78	9.92	0.00	0.00	26.15	0.00	16.78	10.99	2.53	1.87	3.95	1.99	16.34	15.61	24.45	4.62	8.09	3.64	0.00	0.00	0.00	7.36	0.00	0.00	13.57	0.00	0.00
24	ER4c	ExonRegion	0	3.47	4.59	6.19	19.54	11.39	1.87	15.40	1.09	6.86	6.29	0.84	0.68	1.10	1.21	11.05	5.75	16.64	5.07	0.77	11.35	1.03	0.61	0.38	6.31	0.48	1.40	2.92	0.28	0.34