Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC092111.3	Gene	0	4.50	1.60	11.86	1.90	3.78	8.23	2.54	3.99	2.91	4.56	3.26	2.67	4.45	2.25	2.03	2.48	9.01	5.39	1.55	0.86	3.91	1.59	2.32	5.47	2.72	2.36	4.98	15.74	1.82
2	499592	Transcript	0	4.38	0.30	5.53	0.37	1.52	3.96	1.24	1.91	1.40	1.84	1.16	1.09	1.99	1.33	0.38	2.06	5.42	3.99	0.43	0.13	0.98	1.99	1.74	3.67	0.98	0.58	2.76	7.92	0.62
3	500074	Transcript	0	0.15	0.23	0.75	0.00	0.00	0.10	0.40	0.37	0.00	0.22	0.06	0.09	0.31	0.06	0.47	0.15	0.20	0.70	0.00	0.00	0.11	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	0.09	0.01	0.00
4	IG27_SR10	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.66	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.00	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.64	0.00
5	IG27_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.00	3.26	0.56	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.40	0.00	1.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.73	0.00	0.00	0.00	2.18	0.00
6	IG27_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.24	0.00
7	ER1a	ExonRegion	0	1.19	0.00	3.89	0.00	0.00	3.36	0.86	0.00	0.00	2.03	0.78	0.00	2.21	0.00	0.00	3.88	1.90	6.16	0.00	0.00	0.00	3.38	0.58	1.69	0.00	0.00	2.07	14.22	0.00
8	E1_Ab	KnownBoundary	0	5.78	0.00	7.52	0.00	0.00	7.75	5.55	2.34	0.00	3.99	1.61	0.00	4.65	0.00	0.00	3.82	3.87	0.00	0.00	0.00	0.00	3.79	4.53	2.75	1.78	0.00	6.66	22.24	0.00
9	ER1b	ExonRegion	0	1.90	0.00	5.61	2.47	0.00	2.53	3.83	1.85	0.00	0.85	0.16	0.43	1.04	0.47	0.19	1.33	2.00	2.42	1.10	0.00	0.35	2.22	1.22	1.77	0.00	0.55	0.61	6.05	0.00
10	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	3.67	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.82	0.00
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E3a	KnownJunction	0	5.49	0.00	4.31	0.00	0.00	5.29	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	5.39	0.00	0.00	0.00	4.57	4.28	11.31	0.00	0.00	0.00	4.22	0.00
13	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.70	1.41	0.96	1.88	0.00	0.00	0.00	0.28	0.93	0.00	1.52	0.18	0.00	0.00	1.64	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	1.02	0.00
14	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	1.92	0.00	0.00	0.00	6.41	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.85	0.00
15	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	3.26	0.00	4.79	13.26	4.88	3.44	6.09	16.12	6.30	13.42	0.00	0.00	0.97	0.06	0.00	3.87	12.32	1.55	1.60	0.00	2.48	0.00	3.00	1.52	0.00	0.00	1.83	3.15	0.00
16	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.76	0.00	4.33	13.58	0.00	0.00	3.31	20.12	2.25	8.15	0.00	0.00	5.57	0.91	0.00	6.15	12.24	8.19	0.00	0.00	3.67	0.00	1.81	2.15	0.00	0.00	0.00	5.12	0.10
17	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	6.06	3.94	6.40	7.34	2.43	2.09	3.35	16.30	3.24	7.86	0.42	0.00	4.81	1.01	0.81	3.40	14.14	1.85	0.00	0.00	4.06	1.53	1.39	0.86	0.25	0.00	1.31	3.48	0.64
18	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	2.77	3.42	7.70	7.24	10.79	1.70	2.14	17.34	4.59	8.93	0.00	0.66	4.76	1.78	8.28	3.11	15.11	0.00	1.70	0.00	10.25	1.11	0.96	0.00	0.76	0.00	1.87	4.33	1.23
19	E2_Aa	NovelBoundary	0	11.27	0.00	11.71	18.77	41.12	5.26	12.76	32.95	8.53	17.98	0.00	0.00	5.73	1.13	0.00	3.29	9.50	4.50	0.00	0.00	11.79	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.13	0.00
20	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.66	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	3.29	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00
21	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	I2	Intron	0	3.54	6.77	8.28	9.00	2.63	2.76	5.28	14.33	2.99	9.89	0.34	0.53	3.94	1.01	0.66	2.35	12.31	2.63	0.34	1.48	3.84	0.52	2.53	1.31	1.08	0.51	0.99	7.31	0.77
23	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	3.61	10.04	9.41	5.43	1.62	3.62	6.98	11.74	3.77	11.18	0.38	0.69	3.22	1.31	1.07	3.27	9.47	2.01	0.51	0.88	4.93	0.60	2.46	2.07	1.09	0.36	0.44	6.06	0.80
24	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	5.24	5.46	5.53	4.98	2.64	2.23	17.96	3.37	5.54	0.00	0.00	6.18	0.91	0.76	1.92	8.04	0.52	0.00	1.29	3.93	1.80	2.54	1.22	3.01	2.42	0.00	5.24	0.00
25	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	4.93	1.29	0.00	0.96	1.37	0.00	10.41	1.99	6.22	0.00	0.00	5.20	0.42	5.60	2.04	4.39	10.18	0.00	2.81	4.11	0.28	3.20	2.15	2.03	0.00	0.00	6.83	0.00
26	I2_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	1.38	1.07	4.69	0.00	0.00	2.53	0.00	3.64	0.00	1.35	4.64	0.00	0.70	1.07	0.00	0.09	0.22	0.50	0.00	0.00	4.08	0.00
27	I2_AR4	ActiveIntronRegion	0	3.77	0.52	6.15	20.09	4.11	1.46	4.14	11.96	3.18	9.59	0.44	0.38	2.58	0.75	0.00	2.33	10.12	3.44	0.60	3.08	3.98	0.00	2.46	0.02	1.26	1.17	0.34	8.82	0.57
28	I2_SR2	SilentIntronRegion	0	4.17	4.68	8.10	14.83	2.84	3.07	5.14	21.17	2.28	9.04	0.00	0.40	4.51	0.54	0.00	1.72	21.71	4.24	0.00	1.31	2.41	0.84	2.47	1.01	0.28	0.06	1.71	9.17	1.47
29	I2_AR5	ActiveIntronRegion	0	3.82	8.43	10.10	1.98	3.61	1.94	3.51	19.44	1.41	9.09	0.59	0.61	6.97	1.11	0.00	0.61	17.01	0.95	0.00	1.36	2.05	0.45	3.06	1.03	1.21	0.32	3.16	7.98	0.49
30	ER3a	ExonRegion	0	3.95	0.00	10.57	0.00	0.00	10.38	9.52	7.08	2.86	3.43	1.92	1.45	6.45	0.19	0.00	4.39	12.73	7.30	0.00	0.00	2.96	1.41	4.20	7.18	2.34	0.00	6.27	21.64	0.00
31	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E3a_E5a	KnownJunction	0	11.56	0.00	3.76	0.00	0.00	1.96	2.92	2.54	2.92	1.52	0.00	0.00	1.53	1.02	0.00	0.00	14.65	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	2.22	3.05	0.00	0.00	9.24	8.40	0.00
33	E3a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	I3	Intron	0	1.38	0.69	6.24	0.51	0.70	0.30	0.58	0.66	0.72	1.04	0.09	0.22	0.51	0.36	0.00	0.18	3.21	0.69	0.00	0.00	0.72	0.00	0.52	0.62	0.41	0.00	0.00	1.99	0.19
35	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.93	0.00	4.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.96	3.46	0.00	1.05	0.66	0.46	0.00	0.00	5.11	0.00	0.00	0.00	1.95	0.00	0.62	0.74	0.00	0.00	0.00	2.23	0.92
36	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.98	0.88	6.70	0.65	0.89	0.38	0.73	0.84	0.66	0.39	0.11	0.00	0.47	0.33	0.00	0.23	2.72	0.88	0.00	0.00	0.39	0.00	0.49	0.59	0.52	0.00	0.00	1.93	0.00
37	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	6.68	0.00	0.00	3.41	0.00	4.58	5.21	0.00	0.00	0.00	1.34	0.86	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER4a	ExonRegion	0	1.07	1.61	3.60	0.00	0.00	0.67	1.01	0.05	0.00	1.44	0.40	0.62	2.20	0.45	0.00	1.04	1.22	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.63	0.05	0.00
39	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.88	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	25.16	0.00	0.00	11.43	7.55	13.69	1.40	5.87	4.56	0.00	15.51	2.46	0.00	0.00	10.29	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.05	0.00	0.00	13.32	10.42	0.00
41	ER5a	ExonRegion	0	11.10	2.45	26.21	8.19	7.21	9.49	7.22	16.13	1.89	5.57	2.05	0.54	9.48	2.27	0.00	3.29	16.96	10.04	0.00	1.05	3.96	0.98	3.00	7.71	0.25	2.39	7.70	36.46	1.14
42	E5_Da	NovelBoundary	0	6.02	12.70	40.39	19.63	20.63	11.32	7.78	11.25	0.00	13.94	4.33	1.36	20.38	2.19	0.00	10.02	19.16	9.63	0.00	3.89	3.65	0.00	6.35	0.00	1.40	0.00	5.02	13.39	1.78
43	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	E5a_E6b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E5a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	10.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	0.00	4.27	0.00	0.00
46	I5	Intron	0	1.71	0.84	3.70	1.59	1.08	1.76	1.07	3.58	1.74	2.43	1.63	0.41	1.46	0.98	1.14	1.83	4.36	2.40	1.70	0.61	1.58	1.67	1.36	1.24	0.32	0.42	1.22	6.13	0.18
47	I5_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.73	9.56	13.54	3.08	2.16	5.08	12.75	3.63	8.02	2.97	0.00	4.63	1.70	0.00	1.56	3.75	5.83	2.01	1.73	2.66	0.00	2.19	2.71	1.02	0.00	0.18	13.44	1.69
48	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.49	2.42	3.44	0.00	1.45	1.59	0.00	7.14	0.35	2.14	0.88	0.00	0.39	0.16	0.00	1.53	0.53	1.65	0.00	0.00	1.96	0.00	0.71	0.00	0.45	0.54	1.38	5.50	0.00
49	I5_SR2	SilentIntronRegion	0	1.74	0.61	3.23	0.79	0.85	1.76	0.89	2.25	1.79	1.99	1.63	0.51	1.35	1.05	1.41	1.91	5.00	2.22	1.93	0.61	1.43	2.08	1.39	1.30	0.24	0.44	1.28	5.60	0.07
50	E6_Aa	NovelBoundary	0	5.54	0.00	29.52	20.71	0.00	3.72	0.00	17.22	25.03	3.56	11.01	3.16	10.38	4.61	0.00	10.94	18.59	0.00	0.00	7.61	17.41	2.38	6.99	7.66	3.60	5.36	9.99	14.56	6.67
51	ER6a	ExonRegion	0	5.78	0.00	9.56	0.00	5.20	4.12	2.10	6.16	1.66	1.44	1.24	2.37	2.37	3.94	0.00	5.83	6.88	8.31	0.00	0.00	0.06	0.00	0.79	2.15	1.93	0.00	0.56	9.78	1.05
52	ER6b	ExonRegion	0	10.20	1.90	19.60	0.00	4.41	4.02	2.46	2.03	0.87	1.28	2.88	0.88	3.37	1.73	0.00	2.70	9.87	10.31	0.00	1.89	0.36	0.65	1.49	6.16	1.10	0.00	6.63	24.32	0.64
53	E6_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.87	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
54	E6a_E7a	KnownJunction	0	24.30	0.00	16.74	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	4.78	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	13.94	0.00	0.00	0.00	43.54	0.00
55	I6_SR1	SilentIntronRegion	0	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.34	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00
56	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.63	0.00	2.74	0.00	4.22	0.00	0.00	4.77	0.49	0.62	0.00	0.00	0.50	1.18	0.00	2.83	1.28	0.83	0.00	0.00	0.62	2.03	0.78	1.86	1.02	0.00	0.00	0.00	0.58
57	ER7a	ExonRegion	0	15.06	2.15	12.56	0.00	7.55	15.50	3.30	8.96	4.39	3.71	8.07	0.41	6.22	1.69	6.07	1.65	14.16	11.76	0.00	2.38	1.45	3.48	3.14	19.01	2.48	1.89	10.83	42.35	1.49
58	E7_Da	KnownBoundary	0	122.16	161.33	278.20	246.75	224.45	217.51	122.38	168.61	422.13	188.02	157.41	256.29	569.38	142.87	90.69	147.64	176.27	29.03	0.00	85.10	239.54	138.46	213.94	175.20	176.32	80.16	154.91	298.97	270.81
59	ER7b	ExonRegion	0	2.27	1.82	11.64	2.20	3.94	9.04	1.59	2.76	3.80	6.05	3.52	4.19	4.52	3.02	2.30	2.65	9.07	4.08	2.57	0.77	5.83	1.54	2.58	3.84	3.96	3.47	4.68	10.92	2.70
60	IG26_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	2.68	2.63	1.79	0.00	0.00	1.68	0.82	0.53	1.31	0.00	1.19	0.67	0.00	0.91	0.00	0.00	0.00	0.00	3.66	0.66	1.33	0.00	1.05	0.54	0.00	4.77	0.49
61	IG26_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.54	1.46	5.63	0.00	0.00	2.51	0.91	2.11	0.84	1.32	0.40	0.10	1.97	0.23	0.39	0.21	0.31	0.65	0.00	0.23	1.60	0.98	0.91	1.08	1.19	0.27	2.63	4.52	0.00
62	IG26_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.45	0.00	1.47	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	1.57	0.00	1.99	0.00	2.60	0.00	10.88	0.00