Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC022075.1	Gene	0	1.00	1.74	0.48	1.03	3.08	8.77	0.69	6.37	1.83	2.29	0.13	0.27	0.23	1.19	3.61	4.10	5.65	41.17	4.72	0.23	2.06	0.13	1.11	3.18	0.67	1.44	0.03	9.81	0.90
2	500682	Transcript	0	0.90	0.30	0.21	1.21	0.54	3.13	1.01	24.27	0.72	2.35	0.05	0.08	0.89	1.13	3.59	1.02	3.64	71.74	2.19	0.30	0.97	0.52	1.29	3.62	0.94	0.75	0.01	16.65	1.46
3	ER1a	ExonRegion	0	0.01	0.00	0.97	1.38	0.00	3.71	1.94	37.38	1.10	4.03	0.23	0.24	0.25	2.73	5.66	2.39	6.25	85.48	3.69	0.53	0.57	0.09	2.74	9.35	1.31	3.93	0.00	33.39	5.04
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	7.67	0.00	0.00	4.90	1.72	0.00	0.00	0.00	0.00	9.97	3.44	8.37	4.62	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	6.10	0.00	0.00	0.00	25.93	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	45.83	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.00	2.16	136.52	0.00	0.00	0.00	2.14	1.87	5.56	1.63	0.00	0.00	10.02	1.29
6	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.48	0.00	0.00	0.00	2.15	8.77	3.60	2.79	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.45	1.93	0.00	0.00	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	5.34	0.00	0.00	3.58	0.00	5.28	1.42	52.63	1.89	2.34	0.00	0.00	1.72	2.38	14.72	0.00	5.09	148.63	4.79	1.38	0.95	0.67	2.84	4.85	1.02	0.00	0.00	35.09	2.36
8	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.64	0.00	0.00	0.00	1.04	23.52	0.00	2.21	42.38	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	4.18	0.00
9	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	2.75	17.57	0.00	1.60	0.00	0.00	3.47	0.00	0.00	0.00	3.15	55.74	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	23.63	0.00
10	Ix	Intron	0	0.29	1.44	0.00	0.00	0.00	3.19	0.00	0.49	1.15	0.51	0.21	0.38	0.06	0.62	1.03	1.22	2.06	28.95	3.56	0.00	0.51	0.00	0.08	1.44	0.32	0.35	0.00	1.02	0.18
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.03	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00	0.00	20.92	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	1.57	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	19.29	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	3.61	0.00	0.46	0.28	0.36	0.15	1.08	0.00	0.34	1.15	0.62	1.31	27.77	2.40	0.00	0.18	0.00	0.23	1.88	0.36	0.00	0.00	0.82	0.00
14	Ix	Intron	0	0.00	2.07	0.27	0.00	0.79	8.40	0.65	0.59	5.77	2.56	0.00	0.30	0.00	1.38	9.61	2.68	7.44	20.04	5.65	0.00	2.29	0.00	0.29	5.54	0.23	0.25	0.00	0.26	0.00
15	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	2.09	0.27	0.00	0.79	8.46	0.65	0.60	5.81	2.57	0.00	0.30	0.00	1.39	9.67	2.70	7.49	20.17	5.69	0.00	2.31	0.00	0.29	5.57	0.23	0.25	0.00	0.26	0.00
16	Ix	Intron	0	6.94	21.05	2.48	3.87	8.57	130.20	17.94	0.75	35.54	8.77	0.48	1.91	0.26	21.58	57.96	70.73	41.28	136.98	37.93	0.37	10.97	0.24	2.68	56.02	8.86	4.24	1.48	3.96	1.80
17	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	6.98	21.16	2.49	3.89	8.60	130.88	18.02	0.75	35.72	8.82	0.48	1.92	0.26	21.69	58.24	71.07	41.48	137.69	38.13	0.37	11.03	0.24	2.70	56.30	8.91	4.26	1.46	3.98	1.81
18	Ix	Intron	0	4.53	10.60	0.79	8.42	11.48	187.39	23.69	0.00	35.18	13.91	1.40	0.72	0.45	19.63	89.04	69.02	83.15	168.66	54.81	2.59	16.09	0.85	2.12	60.67	9.07	0.74	0.00	2.68	6.59
19	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.57	10.70	0.79	8.50	11.56	189.10	23.89	0.00	35.50	14.03	1.41	0.73	0.46	19.81	89.87	69.66	83.91	170.19	55.32	2.61	16.23	0.86	2.14	61.23	9.15	0.75	0.00	2.71	6.65
20	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	3.68	1.07	19.41	0.00	20.99	7.95	0.00	20.28	3.32	1.33	0.00	0.00	12.12	0.00	10.71	51.88	5.27	0.00	3.72	1.89	0.00	0.00	14.06	5.23	0.00	0.00	2.11	3.14
21	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	2.71	0.00	1.20	0.45	16.23	0.02	2.33	0.00	0.00	0.65	0.40	1.74	0.06	3.06	44.58	1.81	0.00	0.87	0.68	0.68	3.17	0.43	0.02	0.00	8.31	1.21
22	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	1.96	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65
23	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	Ix	Intron	0	0.00	0.17	0.00	0.00	0.79	2.08	0.11	0.00	2.21	0.23	0.00	0.07	0.10	0.73	4.28	0.96	1.05	2.50	2.77	0.00	0.39	0.20	0.29	1.05	0.93	0.34	0.00	0.53	0.32
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.17	0.00	0.00	0.79	2.09	0.11	0.00	2.22	0.23	0.00	0.07	0.11	0.73	4.29	0.96	1.05	2.51	2.77	0.00	0.39	0.20	0.29	1.05	0.93	0.34	0.00	0.53	0.33
26	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	10.46	1.21	0.00	8.50	1.56	0.00	0.00	0.00	0.45	6.06	2.98	2.93	2.99	5.43	0.00	5.12	0.00	0.00	1.42	0.86	0.83	0.00	1.50	0.00
27	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.87	0.00	0.00	7.86	4.49	0.00	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	3.78	3.94	2.51	0.00	0.00	0.00	0.00	4.30	0.00	0.87	0.00	3.26	0.00
28	I3	Intron	0	0.20	1.46	0.28	0.09	0.99	7.32	0.34	0.00	3.39	0.91	0.04	0.27	0.03	0.91	0.82	0.75	1.07	6.00	1.30	0.03	1.34	0.00	0.26	1.80	0.14	0.32	0.02	0.68	0.14
29	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.01	1.23	0.00	0.00	0.86	3.74	0.57	0.00	3.66	0.39	0.00	0.14	0.00	0.23	0.51	0.54	0.26	2.48	0.37	0.00	0.56	0.00	0.10	0.63	0.00	0.00	0.00	0.28	0.11
31	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.66	2.72	0.00	0.00	3.95	14.67	1.77	0.00	8.00	2.94	0.00	0.00	0.00	4.03	1.74	4.23	0.76	19.86	11.08	0.00	3.12	0.00	0.00	12.54	1.26	0.00	1.61	0.00	0.00
32	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	0.38	1.94	0.49	0.00	0.72	7.47	0.12	0.00	4.73	0.76	0.07	0.56	0.00	1.23	0.92	0.73	1.03	4.70	1.59	0.00	2.12	0.00	0.27	2.35	0.13	0.28	0.00	0.48	0.20
33	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.89	0.00	0.00	2.42	0.46	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	2.48	4.29	1.54	0.00	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25	0.00
34	I3_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.02	0.53	0.00	2.33	8.10	0.32	0.00	1.27	0.92	0.00	0.20	0.00	1.20	3.35	0.00	1.36	3.42	1.76	0.00	0.00	0.00	0.57	0.68	0.23	0.50	0.00	0.41	0.00
35	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	0.10	1.17	0.16	0.34	1.14	9.40	0.47	0.00	1.60	1.56	0.06	0.00	0.12	0.57	0.26	1.10	1.54	11.32	0.90	0.13	1.27	0.00	0.25	1.91	0.20	0.66	0.00	1.37	0.13
36	E4_Aa	NovelBoundary	0	2.42	4.75	1.52	0.00	0.00	16.88	0.00	0.00	5.02	2.04	3.23	1.20	0.00	1.17	0.00	3.82	6.75	4.62	16.18	0.00	3.69	0.00	0.00	2.63	0.00	0.00	0.00	4.04	0.00
37	ER4a	ExonRegion	0	0.99	2.12	0.48	0.79	3.75	9.94	0.53	0.24	2.01	2.09	0.13	0.30	0.14	1.01	3.00	4.71	5.76	31.23	5.00	0.16	2.34	0.08	0.87	2.40	0.59	1.31	0.04	6.10	0.35
38	IG24	Intergenic	0	2.89	5.09	1.27	1.98	28.90	34.01	9.14	0.00	4.19	2.10	1.28	0.96	0.16	6.07	1.34	2.82	4.13	34.83	13.82	1.28	6.42	0.00	2.82	12.06	0.64	0.71	0.19	3.10	1.99
39	IG24_SR2	SilentIntergenicRegion	0	5.02	8.10	2.33	3.63	49.82	56.62	16.09	0.00	6.96	3.29	2.11	1.53	0.29	10.39	1.22	3.57	6.24	53.27	23.07	2.35	10.48	0.00	4.81	19.76	0.91	0.70	0.35	3.10	3.30