Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	APOLD1	Gene	0	6.79	18.20	8.50	18.09	12.32	7.15	4.36	4.53	7.80	11.19	6.62	11.63	7.81	17.08	9.58	9.46	8.36	12.80	17.98	6.31	30.13	2.52	44.68	25.99	14.05	6.27	17.20	27.82	4.90
2	326765	Transcript	0	7.24	1.98	1.80	16.52	9.75	3.17	16.41	6.79	4.57	1.11	0.91	2.84	2.88	2.77	35.02	9.53	20.79	5.47	6.86	12.65	3.53	3.88	5.28	5.27	2.42	5.55	1.41	21.02	3.80
3	356591	Transcript	0	3.43	1.96	1.09	9.65	1.98	0.56	1.36	0.73	1.22	1.39	0.38	2.39	1.75	3.80	0.58	3.40	1.38	2.07	1.71	0.00	8.20	0.00	13.32	7.66	2.51	2.97	0.00	7.54	0.92
4	IG10_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	1.97	0.00	0.00	2.99	0.00	1.21	2.76	3.48	2.60	2.38	0.00	0.26	1.72	2.24	0.00	0.40	0.00	3.17	0.00	1.28	0.90	4.34	0.65	0.00	1.57	0.00	0.65	0.00
5	IG10_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.89	13.80	0.00	0.00	7.21	6.95	10.03	4.15	16.45	13.72	10.69	3.19	5.59	5.55	28.85	12.80	7.33	0.00	2.35	1.24	6.64	1.95	5.03	11.17	5.11	2.06	11.96	2.57	0.56
6	IG10_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	2.14	9.85	0.00	0.00	13.52	7.07	6.05	2.37	14.61	15.06	11.73	2.47	2.60	3.24	24.80	18.80	5.58	0.00	0.00	2.81	6.32	2.58	7.23	12.91	15.11	3.14	0.00	0.70	1.34
7	IG10_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.79	13.39	0.00	4.66	4.04	4.91	14.60	1.05	20.30	9.80	9.09	3.81	7.66	4.21	34.71	11.34	3.72	2.54	2.54	1.79	6.87	1.63	5.24	11.94	4.10	2.98	5.01	2.82	1.08
8	IG10_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	13.14	0.00	14.63	0.00	11.00	8.06	3.68	15.35	5.29	11.31	3.09	6.93	4.54	30.80	12.65	7.01	0.00	4.53	0.00	9.51	0.00	2.41	20.44	5.72	0.00	13.43	0.82	0.00
9	IG10_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	1.68	0.00	1.27	25.31	3.83	0.00	9.91	1.44	1.70	0.48	0.93	1.46	1.16	1.41	6.46	10.49	9.32	0.76	2.51	6.05	0.56	0.00	1.42	1.74	1.68	1.85	0.00	2.09	1.31
10	ER1a	ExonRegion	0	14.49	3.96	3.60	33.04	19.51	6.34	32.82	13.58	9.14	2.22	1.83	5.69	5.76	5.54	70.04	19.06	40.44	10.95	13.71	25.30	7.05	7.75	10.57	10.55	4.83	11.11	2.81	42.05	7.60
11	E1_Da	NovelBoundary	0	30.02	3.68	3.64	10.57	7.37	3.57	16.08	39.41	11.72	3.83	0.00	9.43	11.43	14.36	24.72	3.37	31.99	18.49	24.28	12.07	2.05	20.52	2.46	13.88	1.55	11.54	4.37	15.46	2.01
12	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	I1	Intron	0	1.65	3.08	0.56	3.53	3.81	2.37	2.60	2.01	4.21	2.39	1.60	2.14	1.41	1.79	12.00	3.64	8.60	1.04	5.48	2.72	3.23	0.88	1.42	3.57	2.06	1.50	1.60	6.01	1.00
14	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.65	5.66	0.00	12.61	0.00	1.21	5.28	12.95	5.93	0.00	0.00	2.18	3.43	1.60	40.36	7.50	0.00	15.76	13.97	8.97	8.78	9.51	1.59	13.24	0.00	8.29	0.00	4.30	0.00
15	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	14.40	11.65	1.91	41.39	31.87	13.25	28.10	10.55	13.19	8.52	5.96	5.70	5.34	9.51	54.55	16.23	34.89	13.51	27.96	16.01	10.42	1.93	5.80	27.34	7.90	4.70	5.75	22.33	2.67
16	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	42.16	49.27	3.37	111.31	188.19	49.49	102.58	30.28	37.83	31.76	13.36	24.74	24.68	27.92	130.06	59.33	123.21	26.69	56.82	36.85	34.23	5.41	16.07	68.84	22.87	12.57	18.32	97.08	13.42
17	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	44.40	49.27	4.33	105.51	183.61	49.88	98.48	33.14	37.72	27.43	14.28	23.85	23.94	25.53	126.41	60.74	118.20	24.17	57.54	37.34	35.86	7.21	16.79	60.85	20.01	12.57	16.22	94.08	14.00
18	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	2.45	3.57	0.86	4.97	5.12	3.64	3.83	3.19	7.26	3.37	2.09	2.21	1.87	2.74	17.58	5.64	14.26	1.36	7.16	3.80	3.32	1.18	1.61	4.85	2.99	1.80	2.62	7.26	1.52
19	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.43	2.58	0.17	2.15	0.49	0.46	0.27	0.74	2.93	1.30	2.14	1.78	3.77	1.09	8.08	0.50	2.27	0.00	7.48	1.68	3.11	0.90	2.17	0.79	1.29	1.10	1.10	6.68	1.41
20	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	0.48	2.35	0.35	0.95	2.00	1.03	0.44	1.08	1.18	1.49	1.34	1.72	0.68	0.88	4.80	1.75	3.90	0.24	3.72	1.43	2.85	0.50	1.13	1.37	1.21	1.60	1.38	3.65	0.66
21	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	1.37	0.00	0.00	1.51	1.07	0.00	1.53	2.94	1.72	0.97	2.51	1.09	0.45	8.25	3.37	5.69	0.00	5.29	0.85	3.11	0.87	2.60	1.30	0.88	0.49	0.00	7.99	1.00
22	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	1.84	0.00	1.62	0.00	2.47	1.30	0.91	5.60	2.53	3.26	0.00	0.00	0.00	0.00	1.80	0.00	1.61	0.00	0.00	0.00	6.52	1.34
23	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.82	0.00	1.84	1.12	2.45	0.00	1.24	0.26	0.91	11.20	2.53	3.51	0.00	2.26	0.00	0.00	1.26	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	5.54	1.34
24	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.94	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	1.12	2.48	0.85	0.00	0.00	0.91	11.20	2.53	5.15	0.00	4.53	2.01	0.41	0.00	1.81	0.00	0.00	0.00	0.00	9.08	1.34
25	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.00	6.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	1.53	1.44	2.92	0.00	0.00	0.91	11.20	3.68	6.28	0.99	4.53	2.81	1.56	0.00	2.96	0.00	0.00	0.00	0.00	11.41	1.34
26	I1_AR10	ActiveIntronRegion	0	1.61	3.52	0.00	0.00	2.13	0.07	0.00	0.00	1.85	0.64	2.51	1.66	0.00	1.36	5.00	2.03	5.13	1.51	0.97	1.66	4.84	0.00	6.68	1.84	1.91	0.00	0.00	5.94	0.10
27	I1_AR11	ActiveIntronRegion	0	0.36	0.00	0.00	0.00	4.98	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.91	2.33	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.45	2.51	4.29	0.00	0.00	2.17	0.00
28	I1_AR12	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25	1.60	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	1.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	0.00	2.24	1.07	0.00	0.00	1.63	0.00
29	I1_AR14	ActiveIntronRegion	0	7.22	0.00	0.00	0.00	4.06	0.04	1.22	0.00	0.41	3.19	0.00	2.90	0.89	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	4.29	2.00	2.82	0.71	1.62	1.02	0.00	1.28	0.00	0.77	0.00
30	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	1.10	2.78	0.53	1.32	2.01	1.26	1.09	0.89	2.49	2.41	0.85	2.34	0.73	0.93	8.33	1.83	5.97	0.25	3.08	1.38	2.73	0.70	0.92	2.97	1.37	1.14	0.53	5.28	0.46
31	I1_AR15	ActiveIntronRegion	0	0.29	1.96	0.22	0.00	0.52	1.14	0.27	0.43	2.40	0.19	1.92	2.18	3.12	1.30	18.04	2.66	5.41	0.00	2.75	1.78	3.81	1.69	0.24	2.95	1.44	1.90	0.00	4.33	1.17
32	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.36	1.72	0.20	1.55	1.53	0.63	0.24	0.44	1.57	0.88	0.66	0.79	0.23	0.43	5.42	1.77	2.22	0.14	2.75	0.63	2.44	0.17	0.91	1.40	0.86	0.49	0.91	4.34	0.39
33	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72	0.45	1.23	0.00	2.28	0.00	0.22	7.11	2.84	0.48	0.00	0.31	0.00	3.93	0.00	0.98	0.22	0.82	0.00	1.40	4.87	0.00
34	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.64	0.00	1.42	0.00	1.08	0.00	0.83	0.94	0.34	0.71	0.79	0.00	1.84	5.23	2.18	1.34	0.00	1.58	1.00	1.62	0.51	0.01	1.30	0.57	0.00	0.53	6.32	0.31
35	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	8.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.32	0.00
36	ER2a	ExonRegion	0	1.02	1.87	0.09	3.24	0.00	0.00	1.56	2.18	0.65	0.20	0.00	1.84	0.27	0.80	0.00	2.13	0.31	0.40	0.62	0.00	1.95	0.00	4.66	0.73	0.36	1.71	0.00	5.98	0.00
37	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.29	0.00	1.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.74	0.00	5.02	0.00	0.00	0.00	7.01	1.84	0.00
38	E2a_E3a	KnownJunction	0	7.96	0.00	2.17	21.35	0.00	0.00	2.52	0.00	0.00	1.72	0.00	2.56	2.83	7.00	0.00	6.58	3.83	4.62	0.00	0.00	17.73	0.00	30.29	7.72	3.18	7.21	0.00	11.68	0.00
39	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.83	0.00
40	ER3a	ExonRegion	0	6.72	19.32	8.98	18.09	12.42	7.43	3.44	4.32	7.98	11.90	7.03	12.21	8.14	18.08	7.67	9.40	7.48	13.33	18.73	5.85	32.02	2.42	47.47	27.28	14.85	6.29	18.39	28.15	4.93
41	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.77	5.71	4.52	1.39	4.74	9.11	17.54	0.00	0.00	0.00	8.09	0.00	5.94	0.00	7.19	11.72	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER3b	ExonRegion	0	1.30	4.03	1.02	4.35	5.93	1.67	0.00	0.00	3.02	2.27	1.15	2.77	2.15	3.61	1.73	1.51	0.00	1.17	4.53	0.00	4.92	0.00	4.99	14.52	4.00	0.00	0.00	4.95	2.75
43	IG11_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	3.16	0.82	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.58	0.00	0.00	0.44	0.00	4.53	3.66	0.00	0.00	2.70	2.10	0.00	0.00	0.00	0.70	0.77	0.90	5.60	0.00
44	IG11_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.48	2.08	1.42	0.80	0.00	0.00	0.00	1.26	0.69	0.00	0.56	1.02	2.93	1.96	1.53	0.00	0.00	3.13	1.24	0.00	0.00	1.08	0.00	0.00	0.53	6.31	0.00
45	IG11_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.53	0.44	0.00	0.00	1.71	1.70	2.09	2.46	0.00	0.00	0.81	0.53	0.00	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	6.41	0.00