Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AKAP3	Gene	0	3.33	2.34	5.17	4.60	10.81	2.11	5.28	10.85	5.04	4.68	3.38	4.15	6.39	1.86	2.40	2.47	6.81	3.37	1.30	11.37	4.26	9.35	2.32	2.18	4.78	5.97	11.73	11.76	4.20
2	228850	Transcript	0	2.30	1.87	4.27	5.97	12.28	1.95	7.15	5.86	3.74	2.88	2.85	3.14	4.40	1.97	2.02	2.61	4.21	3.91	0.73	10.87	3.23	5.72	3.01	1.46	2.43	2.45	5.59	8.27	2.82
3	IG43_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.69	0.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.82	1.89	1.87	1.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89
4	IG43_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.00	2.61	0.15	0.00	0.00	1.06	0.00	1.76	0.87	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	10.08	2.17	0.97	0.00	0.16	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	1.07
5	IG43_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.53	1.00	2.98	16.49	36.00	1.51	7.29	2.21	1.63	6.21	5.06	3.35	2.72	1.89	3.34	7.57	4.63	2.67	3.69	9.13	7.29	3.26	1.91	1.56	5.87	5.68	6.62	11.49	1.50
6	ER1a	ExonRegion	0	0.03	0.11	2.15	0.00	8.14	2.22	2.75	0.93	0.93	0.00	0.99	0.12	1.88	1.13	0.00	3.09	2.48	0.93	1.47	4.52	2.18	3.81	0.75	1.43	0.51	1.78	3.84	2.62	1.33
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.34	0.00	0.00	0.00	2.63	2.09	0.00	0.00	0.00	1.30	0.00	0.00	0.00	0.00	0.86	0.00	0.00	8.27	1.89	0.00	0.00	3.05	1.44	1.93	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E3a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	9.92	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.62	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.02	0.00
9	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.19	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2a	ExonRegion	0	2.02	4.56	3.96	4.42	14.57	3.18	6.77	0.69	3.01	4.24	2.23	1.73	0.82	2.77	1.06	5.97	1.17	0.00	2.90	12.41	4.95	4.80	1.48	1.48	6.77	1.56	3.09	1.35	1.03
12	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.69	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	4.01	20.28	46.72	5.68	2.23	0.00	2.56	0.00	7.34	3.22	5.89	2.26	8.37	0.00	4.16	0.00	0.00	7.69	5.78	2.48	4.78	0.00	1.74	1.80	13.12	8.76	0.00
14	ER3a	ExonRegion	0	4.13	3.39	6.64	11.05	15.05	3.87	8.08	9.76	1.80	5.29	3.93	5.72	4.24	3.88	3.73	2.74	5.53	4.15	0.00	15.49	4.62	8.07	4.45	1.10	3.89	1.85	9.18	11.17	1.73
15	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E3a_E4a	KnownJunction	0	9.91	0.00	11.29	8.63	0.00	0.00	23.46	8.41	3.14	5.83	4.75	1.20	0.00	2.99	0.00	0.00	8.55	24.66	0.00	14.89	0.00	10.02	9.26	0.00	0.00	0.00	0.00	7.23	0.00
17	ER4a	ExonRegion	0	3.99	2.45	5.81	4.56	10.80	2.28	5.53	12.65	5.34	5.50	3.93	4.60	7.44	1.93	2.53	2.24	8.04	3.92	1.34	11.31	4.48	10.65	2.45	2.48	5.40	6.79	13.80	13.42	4.89
18	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	4.85	0.00	0.00	5.60	0.00	9.44	11.94	10.96	3.79	1.49	7.35	15.79	1.82	0.00	6.88	4.41	0.00	0.00	10.59	1.85	6.81	2.22	2.51	0.00	1.72	2.53	22.11	13.93
19	ER5a	ExonRegion	0	0.60	1.51	2.23	4.76	9.64	0.37	3.46	6.30	5.92	1.22	0.99	3.00	3.58	0.96	2.45	2.60	2.66	1.54	0.85	12.65	3.35	4.85	1.75	1.08	2.11	4.67	4.78	7.73	2.46
20	IG42	Intergenic	0	0.78	1.03	0.92	0.98	3.13	1.38	1.11	1.60	3.77	1.98	1.69	1.32	1.72	1.71	6.53	2.58	2.05	1.26	3.80	3.58	0.65	0.58	0.99	2.16	0.72	1.51	4.02	1.94	1.77
21	IG42_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.75	1.12	1.28	1.00	4.09	1.82	1.27	1.67	5.21	2.32	2.33	1.55	1.94	2.40	7.34	3.07	2.82	1.79	5.58	4.32	0.90	0.50	1.39	2.55	0.60	1.98	6.01	2.62	2.29
22	IG42_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.56	1.71	0.44	1.90	2.59	1.10	0.54	1.96	1.78	1.53	0.95	0.99	1.55	0.48	7.35	2.64	1.19	0.51	0.85	2.93	0.00	0.96	0.48	2.29	1.90	1.25	0.49	0.00	0.00