Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AP003065.3	Gene	0	10.84	2.69	1.69	0.20	0.82	7.18	0.28	1.40	1.58	2.76	1.37	2.37	1.31	10.23	2.20	8.92	9.94	11.26	5.02	6.28	5.65	1.11	0.41	3.56	2.01	2.64	0.05	8.06	0.64
2	500163	Transcript	0	3.82	0.94	0.59	0.07	0.29	2.78	0.10	0.49	0.55	1.55	0.48	0.84	0.46	4.23	0.92	3.11	3.46	5.49	3.05	2.19	2.55	0.39	0.14	2.55	1.26	0.98	0.39	2.95	0.22
3	ER1a	ExonRegion	0	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.05	0.00	2.09	0.49	0.00	0.00	4.91	4.07	0.00	1.82	0.00	0.00	4.11	1.77	0.20	1.17	0.43	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.87	0.00	2.14	0.00	2.04	1.30	1.87	0.00	0.86	0.00	3.06	2.30	0.00	16.18	0.00	0.00	0.00	2.31	8.43	1.40	0.00	0.00	4.58	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	8.94	1.85	1.03	4.43	0.75	3.61	1.25	1.99	2.68	3.57	0.55	0.19	1.61	4.19	1.70	4.22	5.77	12.11	3.46	2.32	3.31	0.84	0.28	2.99	1.77	1.70	0.00	2.52	0.31
7	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	8.97	1.86	1.04	4.45	0.76	3.62	1.25	2.00	2.69	3.59	0.55	0.19	1.61	4.20	1.70	4.23	5.79	12.14	3.47	2.32	3.32	0.84	0.28	3.00	1.77	1.71	0.00	2.53	0.31
8	Ix	Intron	0	14.14	3.47	4.51	1.07	0.49	6.66	0.70	2.02	3.92	2.38	1.90	3.82	0.49	10.80	4.54	3.83	12.38	14.43	2.23	8.10	3.07	0.36	0.45	4.08	2.28	2.90	1.10	4.72	0.23
9	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	10.15	0.00	2.35	0.00	0.00	5.59	1.35	0.22	4.70	0.97	1.89	4.28	2.62	11.39	2.80	4.76	15.01	18.89	5.24	10.91	2.35	0.00	1.21	2.55	1.11	2.11	1.16	8.79	1.77
10	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	18.33	5.66	2.95	1.18	0.80	7.21	0.33	1.92	1.94	3.34	1.68	3.92	0.21	12.63	8.70	4.23	10.66	12.81	4.13	10.06	2.84	0.30	0.00	3.61	2.36	1.29	1.52	5.74	0.12
11	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	12.59	2.83	5.55	1.16	0.39	6.54	0.81	2.30	4.82	2.08	2.02	3.73	0.37	9.86	2.72	3.53	12.94	14.74	0.95	6.83	3.27	0.44	0.58	4.51	2.40	3.80	0.89	3.75	0.11
12	Ix	Intron	0	5.21	1.01	0.52	0.56	0.38	2.27	0.47	1.30	0.79	1.59	0.09	1.07	0.41	3.94	0.72	4.51	4.33	4.71	1.25	4.42	2.46	0.28	0.71	1.69	1.46	1.60	0.57	3.96	0.74
13	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.20	0.98	0.51	0.00	0.00	0.83	1.08	1.12	0.00	1.76	0.00	1.63	0.00	5.27	0.00	1.81	2.82	3.51	0.00	4.10	2.21	0.00	0.33	1.31	0.43	2.09	0.00	1.09	0.41
14	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.26	0.00	0.00	0.00	0.00	1.89	0.33	0.00	1.55	2.97	0.00	1.40	0.00	5.49	0.00	6.16	4.75	5.13	0.00	2.09	3.84	0.00	4.23	4.45	6.86	7.18	2.52	1.96	2.72
15	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	6.20	1.21	0.63	0.90	0.61	2.94	0.25	1.62	0.99	1.27	0.15	0.78	0.65	3.13	1.16	5.35	4.90	5.16	2.01	4.99	2.33	0.45	0.23	1.35	0.90	0.39	0.46	5.54	0.51
16	E2_Aa	NovelBoundary	0	5.43	4.85	0.00	0.00	6.63	1.88	2.86	4.18	1.16	9.15	0.00	0.00	0.00	7.71	8.37	0.00	10.65	4.62	0.00	2.98	2.05	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	8.45	0.00
17	ER2a	ExonRegion	0	11.33	2.81	1.77	0.21	0.86	7.47	0.30	1.46	1.65	2.80	1.43	2.48	1.37	10.60	2.27	9.33	10.39	11.55	5.07	6.57	5.82	1.17	0.42	3.54	2.02	2.76	0.00	8.41	0.67