Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	KLHL35	Gene	0	1.69	1.37	5.43	0.88	0.60	0.72	5.95	6.98	2.32	1.01	0.27	0.64	0.39	1.33	18.86	1.34	1.70	2.32	1.96	8.46	1.00	1.01	1.59	4.53	1.26	1.55	1.51	1.26	2.91
2	441792	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	1.40	0.00	0.00	1.36	0.00	0.11	0.00	0.10	0.10	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	376292	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
4	460787	Transcript	0	1.07	0.59	1.56	0.39	0.53	0.35	2.37	1.55	1.78	0.76	0.19	0.27	0.21	0.42	3.32	0.57	0.57	1.04	0.35	2.52	0.72	0.20	0.39	1.97	0.62	1.11	0.38	0.74	0.60
5	IG50	Intergenic	0	0.08	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	5.78	0.00	0.03	0.20	1.78	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00
6	IG50_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.39	0.00	0.07	0.30	1.69	0.12	0.00	0.00	0.13	0.00
7	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.21	0.21	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.52	0.00	1.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.08	0.75	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.73	3.73	0.00	0.27	1.56	0.65	0.00	0.00	0.73	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.54
10	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.12	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.12	0.00	8.09	0.00	0.00	0.00	0.00	2.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER1c	ExonRegion	0	1.41	1.05	3.28	0.00	0.00	0.45	7.12	4.79	0.73	0.24	0.00	0.30	0.00	0.95	7.94	0.81	1.11	2.51	0.78	0.32	0.23	1.76	0.72	3.32	0.47	0.51	0.78	0.27	1.38
12	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	2.92	1.84	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1a_E2b	KnownJunction	0	5.54	0.00	14.45	0.00	0.00	0.00	0.00	6.87	4.23	0.00	0.00	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	2.57	0.00	0.00	4.67	0.00	1.32
14	E1a_E5a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
15	I1	Intron	0	0.14	0.00	0.34	0.00	0.00	0.09	0.68	0.37	0.00	0.19	0.16	0.25	0.00	0.12	3.70	0.33	0.00	0.52	0.43	3.86	0.10	0.00	0.00	3.61	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.18	0.00	0.42	0.00	0.00	0.11	0.79	0.46	0.00	0.24	0.20	0.20	0.00	0.15	3.25	0.41	0.00	0.48	0.52	4.20	0.12	0.00	0.00	3.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.35	2.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER2a	ExonRegion	0	0.17	0.00	1.39	0.00	0.00	0.00	2.02	0.66	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.17	0.00	0.00	0.15	0.00	0.38
19	ER2b	ExonRegion	0	0.55	2.23	7.45	0.00	0.00	0.76	12.58	14.97	2.06	0.40	0.00	0.95	0.90	0.84	24.14	2.59	1.62	3.83	0.93	6.95	0.40	2.50	2.76	5.02	0.87	1.31	3.57	0.90	7.72
20	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.23	2.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	4.85	10.41	0.00	0.00	0.00	7.84	16.57	1.46	1.72	0.00	2.65	0.00	0.82	16.74	3.29	0.86	0.00	0.00	19.19	0.00	0.00	0.00	2.75	1.55	0.00	6.66	0.00	6.67
22	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.58	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	3.14	1.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER3a	ExonRegion	0	1.84	3.04	20.24	3.07	0.00	0.00	10.42	18.55	0.71	0.00	0.00	1.17	0.56	2.03	24.90	0.81	1.68	1.26	4.03	10.11	1.82	0.00	2.40	8.80	0.91	0.67	5.48	0.29	7.46
24	E3_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	5.09	2.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.28	0.00	0.00	0.00	5.39	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	4.69
25	E3a_E3b	KnownJunction	0	0.00	4.46	20.65	0.00	0.00	0.00	2.29	16.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	25.11	3.82	2.54	4.62	0.00	7.28	0.00	0.00	2.51	3.05	1.93	0.00	2.34	2.25	11.29
26	ER3b	ExonRegion	0	3.03	1.76	1.76	1.17	1.59	1.05	2.19	2.14	3.65	2.27	0.58	0.81	0.63	1.22	9.97	1.72	1.70	3.11	1.04	7.56	2.17	0.59	1.03	5.75	1.87	3.33	1.00	2.21	1.41
27	E3_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	18.14	0.00	0.90	0.00	0.00	4.13	0.00	0.00	0.00	5.32	0.00	0.00	0.00	0.00	1.65
28	ER3c	ExonRegion	0	1.50	1.12	15.33	1.94	0.00	0.00	9.52	13.74	0.83	0.00	0.00	1.01	0.00	1.67	37.98	1.82	3.04	1.51	5.49	10.26	0.77	1.35	4.64	2.88	2.37	0.00	3.50	1.50	6.10
29	E3b_E4a	KnownJunction	0	3.01	0.00	17.59	0.00	0.00	0.00	24.89	16.22	1.55	0.00	0.00	0.00	1.31	2.10	58.00	3.29	6.46	4.62	8.09	18.36	0.00	2.09	6.99	8.43	5.27	0.00	1.99	1.80	3.04
30	E4_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.06	0.00	3.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.18	0.00
31	ER4a	ExonRegion	0	3.13	0.17	18.10	0.00	0.00	1.14	13.73	20.51	4.83	0.39	0.38	0.67	0.83	3.13	53.40	2.36	3.23	3.29	6.63	18.02	0.77	2.28	3.90	8.07	2.37	0.81	1.96	1.98	8.49
32	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.75	0.00	0.00	0.00	7.44	0.00	0.00	2.51	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	3.49	12.23	0.00	0.00	0.00	14.30	25.18	2.50	0.00	1.30	0.00	1.97	2.19	77.93	7.11	4.86	0.00	0.00	34.24	0.00	2.48	13.49	6.10	0.00	0.00	2.29	2.29	0.00
34	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.88	0.00	0.00	0.00	4.37	0.00	2.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.14	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	4.49	0.00
35	ER5a	ExonRegion	0	1.26	2.81	8.38	2.10	0.72	1.76	12.94	15.06	4.25	1.69	0.49	1.08	0.40	2.65	50.68	1.91	3.72	2.89	4.20	26.85	0.63	1.47	2.66	6.98	1.67	2.09	2.35	1.84	4.50
36	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.69	0.00	0.00	0.55	8.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	7.17	0.00	0.00	2.73	0.00	4.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	1.98	0.00	0.00
37	ER5c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.80	0.00	0.00	2.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	IG49	Intergenic	0	12.55	4.86	2.55	4.83	8.21	9.56	8.72	19.22	5.83	4.76	5.87	5.05	6.63	4.09	8.84	4.87	5.32	7.82	9.57	13.75	4.59	3.24	4.38	6.40	3.64	3.19	4.05	4.63	4.25
39	IG49_SR5	SilentIntergenicRegion	0	5.89	0.45	1.06	2.28	5.01	1.47	3.11	8.01	2.60	1.74	1.01	2.75	0.34	1.68	2.46	2.72	2.89	2.10	1.95	3.10	0.76	0.70	0.42	2.66	1.06	0.50	0.00	1.70	1.21
40	IG49_AR9	ActiveIntergenicRegion	0	3.30	1.77	1.07	0.73	6.75	3.23	1.86	5.35	1.29	1.65	0.43	2.84	0.83	1.08	0.94	1.89	2.73	2.70	3.11	1.90	1.98	0.55	0.28	2.20	0.44	0.47	0.19	1.69	2.30
41	IG49_SR4	SilentIntergenicRegion	0	2.86	2.22	0.41	0.96	4.18	2.41	2.35	5.92	2.06	1.86	0.82	2.24	0.69	0.95	1.39	1.35	2.30	4.18	1.86	2.76	1.95	0.49	0.49	2.22	0.90	0.36	0.25	2.98	1.68
42	IG49_AR8	ActiveIntergenicRegion	0	3.24	4.03	2.30	3.19	5.02	2.87	3.91	12.18	3.35	4.05	1.71	6.39	4.77	3.49	5.21	1.84	4.41	9.85	5.21	6.15	4.70	2.14	3.49	2.87	3.16	2.10	0.81	2.04	3.98
43	IG49_SR3	SilentIntergenicRegion	0	5.81	2.13	1.48	1.40	3.34	3.15	3.12	6.85	2.04	3.63	1.08	2.42	1.84	1.14	2.54	1.62	3.87	4.25	2.96	3.03	3.14	1.36	0.93	1.66	0.73	0.82	0.85	1.83	1.49
44	IG49_AR7	ActiveIntergenicRegion	0	2.14	5.16	1.12	0.00	0.00	1.83	3.74	1.84	2.51	0.48	0.00	2.18	4.82	0.00	0.00	2.53	4.25	2.73	0.00	6.83	0.00	0.00	1.81	5.63	2.45	4.49	0.00	1.63	0.00
45	IG49_AR6	ActiveIntergenicRegion	0	5.46	3.28	1.12	0.00	0.00	1.62	2.02	0.17	2.25	2.76	0.00	4.05	4.49	0.00	0.00	2.53	4.01	2.48	4.53	8.43	2.07	0.00	1.81	8.02	2.86	4.71	0.00	2.37	0.00
46	IG49_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	7.58	3.28	0.17	0.00	0.00	4.12	2.02	0.85	1.73	2.89	0.00	4.95	2.60	1.60	0.00	4.28	2.62	0.00	4.53	8.43	2.85	0.00	1.53	5.79	2.86	2.78	0.00	1.63	0.00
47	IG49_AR4	ActiveIntergenicRegion	0	10.72	3.28	0.00	0.00	0.00	4.40	2.02	1.84	2.25	3.61	0.00	7.17	1.95	1.90	0.00	3.80	1.20	3.27	4.53	5.90	4.85	0.00	0.00	8.39	3.14	0.94	0.00	1.96	0.00
48	IG49_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	5.09	2.47	2.02	2.89	1.97	4.60	3.66	6.18	3.76	3.00	1.20	4.45	2.81	2.47	1.86	2.24	4.01	3.80	10.95	7.95	3.26	1.82	2.19	4.25	1.09	1.90	3.32	3.36	0.27
49	IG49_SR1	SilentIntergenicRegion	0	1.92	0.00	0.00	0.00	0.00	1.25	0.00	1.65	2.01	0.00	1.06	0.00	0.00	0.81	0.00	0.00	0.00	1.72	11.43	0.00	0.00	1.61	3.24	5.77	0.00	0.00	6.55	2.92	0.00
50	IG49_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	66.78	26.04	12.20	27.68	35.10	57.07	49.29	101.71	30.84	20.37	39.45	20.74	42.99	22.85	55.29	25.13	20.49	35.71	53.79	82.88	20.88	18.94	28.70	34.49	22.15	20.06	28.00	22.46	21.99