Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	AC026250.2	Gene	0	167.47	12.26	3.53	144.36	55.67	48.84	41.61	38.11	38.93	20.80	16.23	26.16	54.51	24.79	23.96	26.10	33.26	49.92	67.87	192.43	32.45	11.41	32.52	23.46	18.15	7.46	19.88	88.85	45.93
2	498905	Transcript	0	155.40	7.32	3.53	98.03	38.99	35.79	29.11	35.17	21.02	14.42	10.34	19.45	51.18	18.07	26.21	24.95	21.81	42.37	47.84	169.35	22.86	10.95	22.49	12.40	11.33	4.28	15.38	67.36	32.45
3	ER1a	ExonRegion	0	153.31	1.18	6.04	202.54	45.21	18.52	25.91	31.90	5.84	8.10	4.82	15.47	48.22	12.99	21.53	19.56	13.33	39.01	22.39	116.70	11.22	13.04	17.32	6.38	6.60	2.35	8.71	62.74	30.12
4	E1_Da	NovelBoundary	0	5.60	0.00	1.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00	3.82	2.57	0.00	0.00	7.19	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	2.53	4.58	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	315.75	4.65	2.89	19.63	40.67	61.62	36.39	74.10	11.36	20.97	13.13	27.08	106.07	27.50	53.62	53.40	20.87	76.93	80.92	354.12	37.90	21.20	33.98	5.92	12.50	4.38	21.62	101.32	40.97
6	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	2.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	2.32	0.00
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.62	0.63	0.00	0.00	0.00	1.21	0.20	0.72	1.59	0.14	0.12	1.32	0.43	1.11	0.00	0.15	3.02	2.36	0.94	1.47	1.79	0.18	0.71	1.17	0.28	0.62	0.00	4.48	0.85
8	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.43	2.15	0.00	0.00	0.82	1.85	0.00	0.00	1.03	0.00	1.19	0.93	0.00	0.15	0.00	0.41	0.75	2.95	0.00	0.92	1.91	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00
9	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	3.87	1.58	1.10	1.18	1.60	3.38	0.33	0.00	1.20	2.60	0.39	1.21	1.28	1.26	0.00	1.63	2.94	6.15	0.00	1.36	3.04	0.59	1.48	0.35	0.23	0.77	3.00	4.28	0.77
10	Ix	Intron	0	3.52	0.00	0.18	1.57	1.61	0.45	0.00	0.30	0.74	0.71	0.52	0.84	0.39	0.60	0.00	0.91	1.88	3.10	1.93	1.21	1.41	0.20	0.50	0.59	0.78	0.60	0.00	1.79	1.03
11	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.54	0.00	0.19	1.61	1.57	0.46	0.00	0.31	0.74	0.73	0.54	0.87	0.40	0.61	0.00	0.94	1.93	3.18	1.98	1.24	1.42	0.20	0.51	0.58	0.78	0.62	0.00	1.83	1.05
12	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.00	0.00	0.00	4.98	0.00	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.45	0.00	0.00	2.15	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00
13	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	2.49	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.00
14	Ix	Intron	0	4.10	0.80	0.31	0.89	1.81	1.53	0.31	0.85	1.90	1.47	0.51	0.80	1.10	0.41	0.91	0.59	1.47	4.25	1.18	0.68	1.59	0.39	0.45	0.80	0.79	0.49	0.23	3.22	0.87
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.97	0.00	0.31	0.00	4.48	0.50	0.00	0.68	1.23	2.38	0.65	0.23	0.83	0.25	0.85	0.00	0.82	1.77	1.17	0.51	0.79	0.00	0.33	1.18	0.52	0.58	0.00	5.08	1.96
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.64	0.00	0.00	0.00	2.71	1.39	0.68	0.62	2.00	0.55	0.40	1.23	0.88	0.07	0.00	0.84	2.47	2.55	1.08	0.93	1.77	0.61	0.00	0.73	0.00	0.62	1.24	1.34	1.88
17	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	29.56	0.00	0.00	0.00	8.16	7.62	1.43	2.61	1.73	3.13	0.00	2.23	4.55	1.13	2.18	0.46	2.95	11.64	0.00	0.00	3.43	0.50	0.98	1.49	2.02	0.92	0.00	11.05	0.80
18	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	2.21	0.00	0.00	0.00	2.08	3.02	0.00	0.77	1.14	0.97	0.00	1.23	0.30	0.00	2.61	1.83	3.68	4.03	0.00	1.17	1.66	0.54	0.30	0.02	0.36	0.30	1.56	2.08	0.00
19	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	2.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.31	1.12	3.13	0.00	2.47	0.00	0.00	0.00	0.00	6.68	2.73	0.00	0.00	1.43	1.80	1.81	0.00	1.43	1.57	0.00	0.00	0.00
20	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	4.72	1.77	0.00	0.98	0.50	2.03	0.00	0.87	2.33	1.18	0.16	0.66	0.62	0.66	2.14	0.34	1.86	5.52	0.88	0.38	1.58	0.69	0.43	0.29	0.65	0.31	0.00	2.59	0.53
21	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.56	1.01	0.65	1.68	0.48	0.78	0.47	0.80	2.09	1.36	0.84	0.77	1.32	0.41	0.00	0.72	0.69	4.23	1.75	0.86	1.68	0.28	0.57	1.01	1.12	0.49	0.00	2.61	0.54
22	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.80	1.40	0.73	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	0.00	0.98	2.01	0.00	0.65	0.84	0.00	1.20	4.35	0.79	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	0.71	0.59
23	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.68	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.74	0.00	11.08	0.00	0.86	6.62	1.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.00
24	Ix	Intron	0	3.67	1.64	0.22	0.00	1.61	1.63	0.00	0.73	1.33	1.90	0.08	0.57	1.92	0.72	2.72	0.33	1.57	3.55	0.63	1.58	2.53	0.00	0.71	1.27	0.19	0.00	0.00	3.11	1.72
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	3.74	1.67	0.22	0.00	1.64	1.66	0.00	0.74	1.35	1.94	0.08	0.58	1.95	0.73	2.77	0.33	1.60	3.62	0.64	1.61	2.58	0.00	0.73	1.30	0.19	0.00	0.00	3.17	1.75
26	Ix	Intron	0	3.00	0.93	0.08	1.39	1.66	0.73	0.39	1.25	1.25	1.19	0.52	1.28	0.97	0.61	1.42	0.65	1.73	3.12	0.62	0.53	2.34	0.00	0.79	0.62	0.21	0.99	0.18	2.60	0.78
27	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.86	1.40	0.00	4.69	1.77	0.30	0.00	2.49	2.41	0.46	0.94	2.82	1.19	1.03	3.02	0.67	0.72	2.34	1.24	0.60	1.98	0.00	1.18	0.00	0.00	0.34	0.00	1.39	0.29
28	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.77	0.80	0.10	0.45	1.63	0.86	0.50	0.89	0.92	1.40	0.40	0.84	0.91	0.50	0.97	0.65	2.02	3.35	0.44	0.51	2.45	0.00	0.68	0.80	0.27	1.17	0.23	2.95	0.92
29	Ix	Intron	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.93	0.68	0.62	0.38	0.98	0.00	0.00	1.53	0.00	1.56	0.00	1.01	4.66	2.16	0.00	1.45	0.00	0.00	2.18	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00
30	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.94	0.69	0.63	0.38	0.99	0.00	0.00	1.55	0.00	1.58	0.00	1.02	4.73	2.19	0.00	1.46	0.00	0.00	2.21	0.49	0.00	0.00	0.00	0.00
31	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	1.59	0.00	0.00	0.00	0.00	1.09	0.00	0.00	4.15	0.00	0.00	1.11	0.00	0.00	0.00	0.00	1.16	1.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.74	0.00	0.48	0.00	0.00	3.26	1.10
32	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.23	0.34	0.00	0.00	0.00	0.81	0.12	0.20	1.26	1.03	0.16	0.67	2.15	0.13	0.00	1.60	1.78	1.55	1.86	0.40	2.31	0.34	0.80	0.63	0.90	0.29	0.00	1.67	0.70
33	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.61	0.00	0.23	0.00	3.43	1.16	0.28	3.36	0.00	1.42	0.33	0.97	0.36	1.34	1.94	1.39	3.15	3.44	0.45	0.77	0.57	0.42	0.00	1.92	0.40	0.22	0.51	2.54	0.00
34	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	3.85	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.26	0.00	1.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.94	1.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.47	0.00
35	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	8.09	0.00	0.00	0.00	4.98	0.00	0.00	6.03	0.00	2.17	0.00	0.00	0.00	0.00	9.16	0.00	1.91	0.37	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.15	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00
36	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	4.80	0.00	0.00	0.00	2.79	0.00	0.00	7.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	9.19	0.81	2.24	5.46	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23	0.43	1.09	0.00	0.00	2.61	0.00
37	Ix_AR7	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.58	0.00	0.00	0.00	0.00	2.60	0.12	0.37	2.53	2.87	4.18	0.00	0.00	0.00	1.32	1.81	0.00	1.43	0.00	0.00	4.89	0.00
38	Ix_AR8	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.60	0.91	0.00	2.53	3.01	5.80	0.00	0.00	0.00	1.80	1.81	0.00	1.43	0.00	0.00	4.89	0.00
39	Ix_AR9	ActiveIntronRegion	0	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.80	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00	0.64	2.35	2.40	0.00	1.22	2.52	7.04	0.00	0.00	1.43	3.49	0.41	0.00	0.23	0.00	0.00	6.63	0.00
40	Ix_AR10	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	0.00	0.92	1.12	0.00	0.00	1.24	1.30	3.27	0.00	0.00	2.00	3.00	0.00	0.00	1.43	1.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.26	0.00
41	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	5.63	0.00	0.23	0.79	3.54	0.29	0.00	0.00	0.95	1.35	1.19	4.05	0.97	1.59	2.79	0.00	1.08	1.20	0.80	0.00	0.84	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00
42	E2_Aa	NovelBoundary	0	13.92	0.00	0.00	0.00	6.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.97	3.45	0.00	1.97	2.45	1.48	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER2a	ExonRegion	0	251.32	12.88	5.15	196.75	67.90	67.40	57.40	59.53	41.75	29.64	22.75	35.10	78.87	33.35	27.52	30.90	42.24	67.07	92.97	259.95	43.59	17.02	51.94	25.16	25.80	11.02	25.44	122.90	60.77
44	E2_Da	NovelBoundary	0	146.81	39.75	53.74	298.09	140.00	88.28	68.94	65.84	85.88	48.85	60.64	23.16	68.18	43.63	124.97	74.59	88.78	32.49	63.84	143.81	81.02	26.06	32.46	45.34	35.01	23.69	36.18	99.21	62.76
45	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	4.27	2.74	9.49	0.00	1.69	2.52	0.00	4.48	2.04	1.36	3.46	0.00	0.97	8.77	0.00	7.56	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.67	0.00	6.56	1.93	1.45
46	Ix	Intron	0	55.49	8.81	0.65	85.87	28.30	58.20	29.59	22.06	40.61	16.73	12.64	9.41	25.39	6.47	11.03	10.41	25.09	31.76	38.26	108.89	35.27	3.48	20.96	10.39	8.01	8.50	18.04	73.07	26.74
47	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	55.49	8.81	0.65	85.87	28.30	58.20	29.59	22.06	40.61	16.73	12.64	9.41	25.39	6.47	11.03	10.41	25.09	31.76	38.26	108.89	35.27	3.48	20.96	10.39	8.01	8.50	18.04	73.07	26.74
48	E3_Aa	NovelBoundary	0	193.89	150.66	205.87	127.69	116.87	127.73	82.27	85.75	283.60	152.79	73.96	181.80	79.83	155.34	240.78	113.68	414.78	79.37	96.21	144.31	133.13	49.78	99.88	207.38	118.85	143.42	96.07	214.73	141.17
49	ER3a	ExonRegion	0	56.61	13.63	0.82	61.76	41.17	29.71	23.32	10.32	41.70	11.35	9.66	16.16	22.75	15.54	19.61	20.90	25.05	28.83	42.88	115.99	21.58	3.48	9.22	24.55	10.07	3.66	14.56	47.88	28.95