Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	EFCAB4A	Gene	0	24.67	2.07	6.23	25.05	7.14	6.48	6.89	1.92	4.62	7.21	0.99	8.07	7.54	8.17	2.81	4.71	6.12	6.20	0.85	1.05	3.25	2.98	6.46	15.44	3.01	1.73	1.32	1.70	0.98
2	450448	Transcript	0	9.31	0.00	0.32	5.14	0.04	3.61	1.22	0.00	0.60	1.03	0.01	1.09	0.24	0.71	0.00	0.29	1.04	1.26	0.00	0.00	0.06	0.35	0.33	0.66	0.24	0.08	0.11	1.09	0.00
3	450828	Transcript	0	9.54	1.47	2.05	8.88	1.51	3.60	4.09	1.26	0.64	0.99	0.00	5.63	0.31	1.36	0.00	3.07	2.87	3.46	0.00	0.00	0.97	1.23	1.65	5.10	1.49	0.26	0.00	0.37	0.00
4	327417	Transcript	0	17.59	0.41	6.36	24.08	3.59	3.09	3.78	0.43	2.98	4.77	0.00	6.76	3.74	6.73	2.45	3.44	4.18	5.54	2.72	0.07	2.59	1.96	3.38	13.06	1.04	0.74	0.39	1.64	0.13
5	321883	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0	0
6	IG38_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	1.60	0.00	0.00	16.01	5.45	1.54	0.75	0.00	0.42	0.89	0.00	1.37	0.48	1.22	0.00	0.92	0.46	4.14	0.00	0.00	0.43	1.34	0.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER1a	ExonRegion	0	11.22	0.00	0.92	9.46	0.15	0.97	0.00	0.00	0.66	0.17	0.00	0.73	0.73	1.89	0.00	0.00	1.65	2.33	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.63	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00
8	E1_Ab	KnownBoundary	0	38.69	0.00	2.19	21.35	11.79	5.33	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	6.51	2.96	4.14	0.00	5.97	5.87	9.25	0.00	0.00	1.76	0.00	4.58	2.27	1.48	0.00	4.12	0.00	1.22
9	ER1b	ExonRegion	0	21.71	0.00	1.50	4.40	2.62	4.14	0.41	0.00	0.37	0.78	0.01	1.88	1.33	5.64	0.00	2.39	5.26	1.29	0.00	0.00	0.00	0.00	3.32	3.31	0.88	1.54	0.85	0.04	0.00
10	E1_Da	NovelBoundary	0	5.01	8.34	0.00	21.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.51	0.00	0.00	0.00	0.00	1.13	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	7.85	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	2.86	0.00	0.00	0.00	0.00	1.17	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E2b	KnownJunction	0	13.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.37	3.39	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.22	0.00	0.00	1.85	0.00	0.00	0.00
13	I1	Intron	0	5.91	0.55	0.49	2.82	1.92	0.68	2.38	0.00	1.77	1.43	0.00	1.51	0.13	1.07	0.00	0.73	2.20	2.53	0.00	0.00	0.28	0.18	0.00	3.18	1.27	0.31	0.00	0.16	0.13
14	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	3.55	1.39	0.77	1.80	0.00	0.69	2.03	0.00	1.18	1.09	0.00	2.63	0.33	0.68	0.00	0.00	3.33	0.48	0.00	0.00	0.36	0.45	0.00	1.40	1.34	0.39	0.00	0.00	0.10
15	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	7.48	0.00	0.32	3.50	3.18	0.67	2.63	0.00	2.15	1.66	0.00	0.80	0.00	1.33	0.00	1.21	1.49	3.87	0.00	0.00	0.23	0.00	0.00	4.35	1.22	0.26	0.00	0.27	0.15
16	E2_Aa	NovelBoundary	0	10.79	0.00	0.00	31.06	0.00	0.00	0.00	0.00	4.60	0.00	0.00	1.23	0.00	3.17	0.00	0.00	3.38	5.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.38	1.89	0.00	0.00	2.29	0.00
17	E2_Ab	NovelBoundary	0	34.80	0.00	1.00	29.77	0.00	16.57	2.57	2.09	8.44	10.43	2.72	4.64	0.00	5.12	7.57	3.29	2.39	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	3.05	1.89	0.00	0.00	6.78	0.00
18	ER2a	ExonRegion	0	18.18	0.00	0.36	11.09	0.00	11.53	2.02	0.00	1.74	3.96	0.04	2.47	0.25	0.94	0.00	1.14	1.10	2.73	0.00	0.00	0.23	1.40	0.29	2.01	0.97	0.30	0.00	4.36	0.00
19	ER2b	ExonRegion	0	37.78	1.28	6.18	32.06	7.74	10.29	6.18	2.54	5.46	9.73	1.74	10.86	10.97	15.06	1.63	7.11	9.49	8.41	0.95	1.30	4.22	2.27	8.39	16.53	3.82	2.92	2.30	1.87	1.43
20	E2a_E3a	KnownJunction	0	40.05	0.00	8.42	25.24	14.00	7.25	11.04	5.08	6.97	16.86	4.84	25.69	18.92	11.79	8.37	7.19	13.87	0.00	0.00	0.00	3.93	12.15	7.39	27.69	8.26	2.19	18.89	3.77	3.14
21	ER3a	ExonRegion	0	26.64	1.47	9.25	25.33	6.40	8.55	7.25	1.82	9.63	8.60	2.87	15.60	12.99	9.12	5.55	11.52	10.57	5.19	0.00	0.00	2.71	4.97	7.06	14.33	3.71	2.79	3.68	2.43	1.71
22	E3_Da	KnownBoundary	0	21.41	0.00	2.19	10.57	7.22	1.96	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	6.39	0.00	3.59	0.00	3.82	2.63	0.00	0.00	0.00	1.56	0.00	0.00	8.55	1.89	1.93	0.00	0.00	0.00
23	E3a_E4a	KnownJunction	0	18.17	0.00	10.29	35.37	11.79	5.49	7.67	0.00	9.59	6.11	0.00	3.95	15.70	7.51	0.00	14.92	3.67	9.25	0.00	0.00	0.00	3.99	8.62	5.98	7.08	5.54	0.00	2.29	1.85
24	ER3b	ExonRegion	0	9.54	1.47	2.05	8.88	1.51	3.60	4.09	1.26	0.64	0.99	0.00	5.63	0.31	1.36	0.00	3.07	2.87	3.46	0.00	0.00	0.97	1.23	1.65	5.10	1.49	0.26	0.00	0.37	0.00
25	E3_Db	NovelBoundary	0	5.84	0.00	0.00	0.00	0.00	3.18	4.75	0.00	0.00	2.04	0.00	4.70	0.00	2.46	0.00	0.00	2.32	0.00	0.00	0.00	0.00	4.47	2.07	6.10	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
26	I3	Intron	0	17.16	0.00	0.99	10.63	0.00	5.30	3.59	2.18	2.50	0.00	0.00	3.47	0.00	1.61	1.37	1.47	3.10	2.28	0.00	0.00	1.27	0.00	0.00	3.83	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	17.36	0.00	1.00	10.71	0.00	5.35	3.63	2.21	2.52	0.00	0.00	3.51	0.00	1.63	1.38	1.49	3.13	2.30	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	3.86	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	E4_Aa	NovelBoundary	0	23.95	0.00	3.49	10.78	0.00	3.03	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	1.27	0.00	3.15	0.00	0.00	3.35	0.00	8.09	0.00	1.72	2.04	0.00	5.50	1.70	1.67	0.00	0.00	0.00
29	ER4a	ExonRegion	0	36.20	0.91	8.83	30.87	8.34	7.40	12.62	2.08	5.75	6.96	1.68	10.13	8.64	8.29	2.23	8.32	4.52	6.72	1.80	0.71	2.88	3.66	8.07	15.85	4.95	1.19	2.58	2.04	2.45
30	E4_Da	NovelBoundary	0	14.04	0.00	2.77	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.99	0.00	0.00	2.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.87	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E4a_E5a	KnownJunction	0	19.47	0.00	5.33	20.28	5.75	1.96	2.35	0.00	2.92	3.64	0.00	10.90	7.55	8.04	16.74	3.06	6.37	0.00	0.00	2.98	1.56	6.71	9.60	25.84	0.00	1.67	0.00	1.84	0.00
32	I4	Intron	0	10.56	0.00	1.53	1.64	0.00	2.52	0.69	1.27	0.90	1.32	0.55	2.33	0.45	0.67	1.79	0.98	1.03	1.10	0.73	0.63	1.14	0.62	0.00	3.70	0.49	0.00	0.00	0.00	0.15
33	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	10.61	0.00	1.54	1.65	0.00	2.53	0.70	1.27	0.90	1.33	0.55	2.34	0.45	0.68	1.80	0.98	1.03	1.11	0.74	0.63	1.15	0.62	0.00	3.71	0.49	0.00	0.00	0.00	0.15
34	E5_Aa	NovelBoundary	0	2.83	0.00	1.54	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	0.00	1.60	0.00	1.87	0.00	2.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
35	ER5a	ExonRegion	0	31.20	0.00	8.60	25.27	13.18	5.41	7.91	1.28	4.33	7.81	1.34	8.60	11.05	9.52	2.06	5.34	7.73	5.14	2.22	1.49	3.37	2.01	8.28	14.59	5.25	0.63	0.00	2.05	0.68
36	E5a_E6a	KnownJunction	0	19.05	0.00	14.38	30.84	0.00	3.15	21.68	0.00	0.00	13.34	1.23	7.02	1.50	10.48	0.00	7.11	5.09	4.62	0.00	0.00	6.42	2.14	9.16	8.55	1.93	0.00	0.00	2.29	0.00
37	E6_Aa	NovelBoundary	0	10.50	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	2.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
38	ER6a	ExonRegion	0	16.61	1.87	7.66	31.99	8.49	8.36	9.80	0.00	1.52	7.71	0.53	7.34	3.53	11.18	0.00	2.62	5.58	7.35	0.00	1.53	2.77	6.10	6.29	18.68	2.94	0.82	1.06	0.94	0.27
39	E6_Da	KnownBoundary	0	10.91	0.00	1.49	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	1.21	8.46	0.00	3.14	3.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.20	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00
40	E6a_E6b	KnownJunction	0	8.38	0.00	5.81	50.69	0.00	0.00	2.80	0.00	1.22	7.35	0.00	6.05	11.85	3.08	0.00	0.00	4.41	0.00	0.00	0.00	3.81	2.38	0.00	7.96	3.30	0.00	0.00	2.20	1.58
41	ER6b	ExonRegion	0	15.91	0.00	1.78	11.07	7.02	3.72	4.04	0.00	1.04	2.54	0.00	1.30	1.10	4.45	2.64	1.52	2.38	1.81	0.00	0.06	0.28	0.46	1.62	7.57	0.87	1.09	0.66	0.88	0.00
42	E6_Ab	KnownBoundary	0	18.70	0.00	3.71	21.57	0.00	1.92	5.84	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.22	0.00	3.82	5.94	0.00	0.00	0.00	0.00	2.33	0.00	11.25	0.00	6.57	0.00	0.00	0.00
43	ER6c	ExonRegion	0	24.25	0.00	13.83	26.63	8.12	5.29	9.57	1.02	2.76	15.38	0.00	11.45	9.45	8.27	0.00	4.18	5.55	4.18	1.48	1.34	4.99	8.50	7.19	14.36	4.43	1.95	0.00	1.05	0.88
44	E6_Db	NovelBoundary	0	3.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	1.84	0.00	2.68	0.00	2.39	0.00	3.37	3.35	0.00	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	8.67	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E6b_E7a	KnownJunction	0	15.81	0.00	12.68	39.26	0.00	1.76	2.52	0.00	5.45	4.99	0.00	12.83	4.68	10.72	0.00	5.97	6.24	9.25	8.09	0.00	3.37	2.43	5.02	17.11	0.00	0.00	0.00	2.11	0.00
46	E6b_E7b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.40	0.00	0.00	0.00	0.00
47	I6	Intron	0	4.32	1.86	0.56	2.41	0.00	0.46	2.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	1.21	1.84	0.00	1.50	1.29	0.00	0.92	1.91	0.00	0.00	1.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
48	I6_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.37	1.88	0.57	2.44	0.00	0.47	2.74	0.00	0.00	0.00	0.00	0.83	0.00	1.23	1.87	0.00	1.52	1.31	0.00	0.94	1.94	0.00	0.00	1.46	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	E7_Aa	NovelBoundary	0	9.02	0.00	0.00	9.92	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.72	0.00	0.00	0.00	0.84	0.00	3.67	5.11	0.00	0.00	0.00	1.76	0.00	0.00	5.26	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	ER7a	ExonRegion	0	21.06	1.24	4.63	21.90	3.75	3.79	4.78	1.30	2.44	6.79	0.00	6.16	5.45	5.03	4.70	2.84	3.93	5.57	0.08	0.14	4.11	2.98	3.49	14.51	2.26	1.12	0.52	1.93	0.37
51	E7_Ab	KnownBoundary	0	33.33	0.00	1.54	0.00	7.37	3.61	5.72	0.00	1.52	3.71	0.00	0.00	0.00	2.28	8.17	0.00	2.48	0.00	0.00	2.98	0.00	0.00	2.31	13.76	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
52	ER7b	ExonRegion	0	25.78	3.15	5.39	31.10	8.56	6.14	5.76	3.22	5.02	14.05	0.85	9.18	8.60	7.74	0.95	5.31	7.52	13.30	2.29	2.69	3.70	4.67	7.23	23.39	3.00	1.97	0.39	3.05	0.00
53	E7a_E8a	KnownJunction	0	36.69	8.82	13.83	39.90	0.00	7.02	16.82	4.98	3.11	8.39	0.00	15.06	13.12	12.34	0.00	18.90	13.03	18.49	0.00	0.00	5.98	2.48	8.03	38.64	7.24	1.89	2.19	5.89	0.00
54	ER8a	ExonRegion	0	22.34	7.53	10.01	38.07	11.13	7.46	11.20	4.49	10.42	9.63	1.88	10.61	12.65	8.92	6.40	4.54	7.98	9.38	1.81	2.85	5.55	4.76	12.00	28.54	3.70	2.71	2.01	2.47	2.05
55	ER8b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00