Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
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2	343202	Transcript	0	0.00	0.00	19.78	0.00	21.22	1.65	21.97	37.13	25.67	14.70	0.00	28.10	0.00	0.00	0.00	13.54	65.84	4.62	0.00	0.00	3.33	2.48	0.00	13.88	11.25	4.38	0.00	0.00	6.50
3	309737	Transcript	0	0.00	0.00	2.81	0.00	4.36	2.50	6.95	14.98	6.50	3.61	0.00	5.57	0.32	0.00	0.00	1.58	13.86	0.68	0.00	0.00	0.53	0.23	0.00	4.09	3.26	0.39	0.00	0.00	1.68
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9	ER1b	ExonRegion	0	0.88	4.88	15.54	2.30	26.94	2.94	17.85	15.63	12.90	13.99	0.00	23.54	4.54	0.00	0.00	5.13	46.76	0.00	0.14	0.00	0.08	1.26	0.58	4.46	5.60	0.00	0.00	0.00	5.66
10	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55
11	E1a_E2a	KnownJunction	0	2.65	0.00	1.10	0.00	12.97	1.84	2.92	7.27	9.32	0.00	0.00	5.87	1.62	0.00	0.00	3.82	5.11	0.00	0.00	0.00	1.60	1.90	0.00	3.05	3.14	0.00	0.00	0.00	0.00
12	E1a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER2a	ExonRegion	0	0.83	2.17	11.06	0.00	15.89	5.30	23.19	28.87	16.98	25.52	0.83	30.67	9.06	0.23	0.39	7.80	53.14	1.83	3.51	0.79	2.43	2.76	0.00	4.00	13.60	1.41	0.82	0.37	6.37
15	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	9.29	0.00	0.00	0.00	29.01	14.23	14.77	10.71	0.00	20.15	3.03	0.00	8.37	3.82	31.09	4.62	0.00	3.72	1.72	0.00	0.00	7.72	9.21	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	12.18	0.00	6.34	1.53	5.21	2.54	4.29	12.50	0.00	1.39	17.04	0.00	0.00	0.00	11.21	0.00	0.00	0.00	3.97	0.00	0.00	5.98	1.59	0.00	0.00	0.00	5.22
17	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.46	0.00	0.69	0.00	12.65	5.93	3.50	3.49	0.00	6.77	1.19	0.00	4.04	1.97	7.23	2.12	0.75	2.81	0.48	0.00	0.00	1.31	4.76	0.00	0.00	0.00	0.00
18	E2_Db	NovelBoundary	0	0.00	19.39	4.21	0.00	78.55	7.48	28.04	28.32	34.87	7.03	0.00	13.70	1.27	1.09	0.00	7.57	48.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.51	2.45	18.15	2.19	0.00	0.00	3.70
19	I2	Intron	0	0.30	3.96	11.54	0.00	19.61	2.91	16.20	27.36	27.55	16.48	0.59	21.24	5.97	0.13	4.01	6.02	49.64	0.95	1.13	0.19	2.71	0.76	0.51	14.70	11.78	2.77	2.45	0.34	3.29
20	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.41	4.42	15.53	0.00	22.65	3.20	18.38	31.30	34.91	18.09	0.57	26.26	7.80	0.17	4.36	6.70	66.66	0.91	1.52	0.26	3.12	0.68	0.69	16.94	12.87	3.73	2.26	0.31	4.06
21	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	2.81	0.00	6.64	5.50	0.00	0.00	0.19	1.20	0.00	2.47	0.87	0.00	0.00	0.00	10.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.79	2.62	0.00	0.00	0.00	0.00
22	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	2.75	0.00	0.00	11.13	1.96	10.37	16.79	6.72	12.34	0.68	7.05	0.74	0.00	3.13	4.24	0.43	1.10	0.00	0.00	1.63	1.03	0.00	8.58	8.94	0.00	3.13	0.46	1.15
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24	ER3a	ExonRegion	0	0.00	4.24	19.21	0.00	40.38	5.32	28.33	40.75	48.12	18.07	1.03	23.01	17.45	1.12	3.54	5.16	46.47	3.88	1.73	3.11	5.05	2.04	1.21	14.38	22.21	3.58	0.36	0.00	12.11
25	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.51	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	29.35	0.00	34.34	8.06	26.83	65.14	54.21	30.84	2.59	46.41	19.58	0.00	18.34	17.52	76.58	0.00	0.00	3.72	8.02	2.48	0.00	16.87	30.08	5.88	2.29	0.00	18.55
27	E3a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
28	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.83	1.23	0.00	0.00	0.36	0.00	0.00	0.00	0.43	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00
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30	E4_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	3.99	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00	11.88	9.59	0.00	0.00	1.62	0.00	0.00	0.00	9.75	0.00	0.00	0.00	2.05	0.00	0.00	0.00	3.86	0.00	0.00	0.00	3.43
31	E4a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.57	2.80	9.26	3.44	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.81	1.52	0.00	0.00	0.00	0.00
32	E4a_E6b	KnownJunction	0	0.00	0.00	19.78	0.00	21.22	1.65	21.97	37.13	25.67	14.70	0.00	28.10	0.00	0.00	0.00	13.54	65.84	4.62	0.00	0.00	3.33	2.48	0.00	13.88	11.25	4.38	0.00	0.00	6.50
33	E4a_E7a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.78	0.00	13.04	4.13	1.16	0.00	0.00	2.92	0.00	0.00	0.00	0.00	7.18	5.39	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	I4	Intron	0	0.09	0.55	0.80	0.00	0.65	0.70	1.16	1.13	3.10	3.97	0.08	3.76	0.93	0.01	0.22	0.50	4.85	0.05	0.04	0.00	0.74	0.14	0.05	0.34	1.45	0.25	0.00	0.00	0.39
35	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.55	1.20	0.00	0.42	0.70	1.54	1.09	2.89	2.87	0.00	4.85	1.10	0.00	0.47	0.84	3.97	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.00	0.37	0.59	0.27	0.00	0.00	0.00
36	I4_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.00	0.00	1.23	0.90	0.10	7.52	3.92	0.00	13.61	0.00	0.00	0.00	0.00	4.22	0.00	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	2.50	0.00	0.00	0.00	0.00
37	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.36	1.32	0.00	1.09	0.55	1.99	1.69	2.86	2.84	0.00	6.99	1.44	0.00	0.61	0.88	6.52	0.00	0.00	0.00	1.26	0.00	0.00	0.24	2.35	0.00	0.00	0.00	1.50
38	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	1.21	0.00	0.00	1.21	5.24	1.84	4.31	2.83	0.05	7.37	5.40	0.00	4.26	2.53	13.58	0.00	0.00	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	8.63	1.51	0.00	0.00	1.07
39	I4_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.96	1.44	3.29	0.00	4.37	0.61	3.02	7.61	8.29	11.59	1.05	9.14	10.68	0.00	1.52	1.47	11.26	0.00	0.00	0.00	3.48	1.61	0.00	1.92	7.94	0.37	0.00	0.00	2.70
40	I4_SR3	SilentIntronRegion	0	0.00	0.17	0.62	0.00	0.26	0.80	0.96	0.78	3.09	5.23	0.00	2.78	0.34	0.05	0.00	0.13	3.64	0.00	0.17	0.00	1.05	0.00	0.03	0.23	1.17	0.58	0.00	0.00	0.29
41	I4_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.11	3.02	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	4.74	0.00	0.00	0.00	0.26	1.39	1.81	0.00	2.60	0.00	0.00	0.00	0.00
42	I4_SR4	SilentIntronRegion	0	0.12	0.32	0.39	0.00	0.00	0.53	0.62	1.17	1.91	2.89	0.00	1.74	0.22	0.00	0.00	0.14	2.77	0.01	0.00	0.00	0.08	0.10	0.00	0.00	0.54	0.18	0.00	0.00	0.15
43	I4_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.35	2.13	0.76	0.00	0.81	1.16	1.22	0.01	4.92	4.58	0.59	3.26	0.43	0.00	0.00	1.23	11.60	0.00	0.00	0.00	0.71	0.30	0.00	0.36	1.00	0.00	0.00	0.00	0.22
44	I4_AR7	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.19	0.00	5.14	2.03	1.37	1.84	3.38	5.70	0.00	7.71	0.68	0.00	0.00	1.23	10.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.39	5.75	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E5_Aa	NovelBoundary	0	0.00	18.13	2.69	0.00	6.34	1.96	20.43	7.56	7.73	10.71	8.07	10.90	5.76	0.00	0.00	0.00	16.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.72	8.90	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER5a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.24	0.00	7.08	0.11	1.96	0.58	0.18	1.37	0.00	3.97	0.00	0.00	0.00	0.00	1.77	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.18	0.00	0.00	0.00	0.99
47	E5_Da	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	5.84	0.00	0.00	5.99	0.00	3.01	0.00	0.00	0.00	2.91	1.35	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00
48	E5a_E6a	NovelJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	E5a_E6b	KnownJunction	0	0.00	0.00	5.43	0.00	20.63	0.00	5.15	6.47	2.31	2.04	0.00	10.42	0.00	0.00	0.00	0.00	7.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	9.62	0.00	0.00	0.00	4.39
50	I5	Intron	0	0.20	0.15	1.34	0.00	1.38	0.52	1.33	1.82	5.66	4.21	0.45	4.11	0.97	0.00	0.00	1.10	5.26	0.00	0.15	0.00	0.13	0.08	0.00	0.81	2.02	0.22	0.00	0.00	0.69
51	I5_SR1	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.39	0.00	1.25	4.17	1.10	1.66	0.00	0.00	0.00	0.00	2.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.58	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00
52	I5_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.27	0.00	0.74	0.83	2.28	1.64	8.19	4.28	0.18	5.40	0.78	0.00	0.00	0.75	3.98	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.54	2.00	0.00	0.00	0.00	0.15
53	I5_SR2	SilentIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.45	2.13	6.19	2.13	2.82	7.73	0.00	0.00	0.00	5.55	4.80	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.03	0.00	0.00	0.00	2.10
54	I5_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.34	0.26	1.61	0.00	1.96	0.44	0.81	2.04	4.68	4.37	0.32	3.33	1.25	0.00	0.00	0.98	6.23	0.00	0.26	0.00	0.23	0.14	0.00	0.35	2.20	0.38	0.00	0.00	0.91
55	E6_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.60	6.43	0.00	2.92	3.69	0.00	0.00	0.00	7.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
56	E6_Ab	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.95	0.00	17.83	0.00	9.50	0.00	0.00	0.00	0.00	6.87	0.00	0.00	0.00	0.00	1.71	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
57	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	5.61	0.00	8.72	3.44	11.09	20.71	9.55	7.22	0.00	11.13	0.65	0.00	0.00	3.16	23.54	1.36	0.00	0.00	1.07	0.45	0.00	5.38	5.00	0.79	0.00	0.00	3.36
58	ER6b	ExonRegion	0	0.59	3.53	40.37	0.00	31.81	8.90	31.58	54.79	42.60	31.13	0.00	32.76	7.85	1.60	2.20	8.80	91.98	3.05	1.75	2.31	3.59	1.96	0.64	16.63	20.18	4.57	0.00	0.00	9.63
59	E6a_E7a	KnownJunction	0	2.48	16.48	41.63	0.00	50.25	3.61	49.43	45.59	62.49	29.00	0.00	22.50	4.46	1.22	7.57	21.11	92.13	0.00	8.09	2.98	7.50	4.52	0.00	32.18	13.75	6.39	0.00	0.00	21.59
60	E7_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.55	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
61	ER7a	ExonRegion	0	0.31	2.08	9.34	0.00	6.49	1.99	7.99	21.78	12.06	7.75	0.51	14.85	4.05	0.33	1.25	2.70	28.02	0.65	0.75	0.17	1.02	0.89	0.34	6.51	6.39	2.11	0.37	0.03	5.79