Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-108L7.2	Gene	0	0.32	0.96	0.00	0.00	0.00	1.84	0.30	0.27	1.00	0.65	0.18	1.10	0.29	1.08	0.69	1.48	1.78	2.59	0.48	1.23	0.21	0.00	0.00	0.32	0.00	0.47	0.27	0.49	0.00
2	447344	Transcript	0	0.21	0.63	0.00	0.00	0.00	1.21	0.20	0.18	0.66	0.42	0.12	0.72	0.19	0.71	0.45	0.97	1.17	1.69	0.31	0.81	0.14	0.00	0.00	0.21	0.00	0.31	0.18	0.32	0.00
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	0.00	17.06	2.49	0.00	7.37	10.90	2.57	0.00	3.11	0.00	1.58	10.33	3.44	4.36	7.77	3.82	5.96	4.62	8.09	0.00	1.80	0.00	0.00	27.28	1.93	0.00	0.00	0.00	0.00
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	2.64	3.97	2.06	0.00	2.01	3.98	0.83	0.00	11.98	1.78	1.96	4.82	2.40	5.21	3.79	2.04	9.21	4.09	0.00	1.13	0.59	0.00	0.00	2.65	0.59	0.65	0.00	4.02	2.21
7	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.67	4.01	2.08	0.00	2.03	4.01	0.84	0.00	12.08	1.80	1.97	4.86	2.42	5.24	3.82	2.06	9.28	4.13	0.00	1.14	0.59	0.00	0.00	2.68	0.59	0.65	0.00	4.06	2.23
8	Ix	Intron	0	1.93	7.73	4.01	0.00	11.72	5.77	0.00	0.00	2.70	3.47	0.71	3.70	0.00	4.22	3.03	10.00	9.85	2.41	1.92	1.65	0.43	0.00	0.00	0.65	0.43	0.94	1.10	3.42	2.01
9	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.74	14.39	2.48	0.00	7.24	4.88	0.00	0.00	0.29	2.13	0.62	1.35	0.00	1.73	2.40	5.06	1.60	1.10	0.00	0.47	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.94	0.00	0.35	0.03
10	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.02	5.63	4.59	0.00	13.40	6.16	0.00	0.00	3.54	3.96	0.76	4.54	0.00	5.11	3.29	11.81	12.75	2.88	2.59	2.07	0.58	0.00	0.00	0.87	0.58	0.96	1.48	4.50	2.71
11	Ix	Intron	0	0.85	3.49	1.33	2.86	3.89	2.19	0.80	0.00	3.12	0.00	0.47	3.19	0.52	2.88	0.00	2.69	2.38	4.61	0.00	5.97	0.57	0.72	0.00	0.86	0.00	0.63	1.46	0.65	0.80
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.87	3.55	1.34	2.90	3.95	2.23	0.82	0.00	3.17	0.00	0.48	3.24	0.53	2.93	0.00	2.73	2.42	4.68	0.00	6.07	0.58	0.73	0.00	0.85	0.00	0.64	1.48	0.66	0.81
13	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	0.00	1.45	0.00	0.00	3.53	0.00	0.00	1.37	9.03	0.00	8.19	4.11	1.13	0.00	0.00	5.76	9.25	0.00	4.13	0.00	0.00	2.17	0.00	4.93	4.38	0.00	1.98	12.97
14	ER2a	ExonRegion	0	0.63	1.89	0.00	0.00	0.00	3.63	0.59	0.54	1.97	1.27	0.35	2.17	0.57	2.12	1.35	2.91	3.50	5.08	0.94	2.42	0.42	0.00	0.00	0.63	0.00	0.92	0.54	0.96	0.00