Order	SeqName	SeqType	IsAE	ABC_RG012	ABC_RG016	ABC_RG015	ABC_RG046	ABC_RG047	ABC_RG048	ABC_RG049	ABC_RG058	ABC_RG059	ABC_RG061	ABC_RG073	ABC_RG074	ABC_RG086	GCB_RG003	GCB_RG005	GCB_RG006	GCB_RG007	GCB_RG010	GCB_RG014	GCB_RG045	GCB_RG050	GCB_RG055	GCB_RG062	GCB_RG063	GCB_RG064	GCB_RG071	GCB_RG072	GCB_RG069	GCB_RG085
1	RP11-25C19.2	Gene	0	0.92	0.46	0.00	0.00	0.00	0.39	0.29	0.00	2.32	0.00	0.17	0.88	0.46	1.22	1.31	0.71	2.76	0.82	0.46	0.28	2.24	0.51	0.26	0.61	0.20	1.12	0.00	0.23	0.85
2	443652	Transcript	0	0.40	0.25	0.00	0.00	0.00	0.18	0.15	0.00	1.11	0.00	0.07	0.41	0.25	0.55	0.71	0.33	1.23	0.32	0.18	0.11	1.12	0.24	0.10	0.33	0.08	0.43	0.00	0.09	0.46
3	ER1a	ExonRegion	0	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.00	0.00	1.70	0.00	0.33	0.85	0.00	1.37	0.00	0.68	3.29	1.59	0.88	0.55	1.18	0.50	0.50	0.00	0.39	2.17	0.00	0.45	0.00
4	E1_Da	NovelBoundary	0	2.89	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.16	1.64	0.00	1.14	0.00	2.13	0.00	0.00	3.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	4.38	0.00	2.29	3.24
5	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	Ix	Intron	0	1.23	3.04	0.24	0.00	0.31	1.47	0.84	0.56	4.43	1.45	1.22	2.55	1.50	1.58	4.21	1.50	4.96	0.75	1.58	0.44	3.44	0.69	0.55	1.51	0.59	1.25	0.47	1.02	1.21
7	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.55	2.68	0.22	0.00	0.00	2.30	0.00	0.95	3.61	2.24	0.92	1.75	0.17	1.05	2.84	1.28	2.70	0.99	0.41	1.42	3.12	0.23	0.23	0.00	0.18	1.42	0.00	1.05	0.43
8	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.54	5.12	0.00	0.00	0.00	1.14	0.72	1.09	1.46	1.37	0.99	2.26	0.92	0.96	1.74	1.76	4.42	0.46	1.13	0.00	2.53	0.64	0.86	3.31	0.34	0.37	0.65	1.54	2.14
9	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.89	2.96	0.00	0.00	0.00	2.64	0.00	0.00	2.39	1.80	0.23	2.95	1.33	1.81	0.00	3.09	2.85	0.00	2.91	0.00	5.53	0.00	0.00	0.68	0.00	0.65	0.76	0.00	2.05
10	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.29	2.92	0.00	0.00	0.00	1.84	0.82	0.07	6.61	1.18	2.41	4.41	2.72	3.37	11.28	0.34	6.30	0.52	3.83	0.85	5.37	0.29	0.19	0.95	1.05	0.76	0.50	0.44	2.83
11	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	13.41	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	1.79	5.13	1.87	2.03	6.82	1.30	2.89	5.75	0.00	7.01	0.00	0.00	2.73	1.81	2.34	0.54	3.20	2.78	2.04	0.00	0.00	1.16
12	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.75	4.63	0.84	0.00	1.28	1.04	3.10	2.31	11.11	1.82	4.01	7.86	3.02	3.27	12.53	7.58	24.03	3.07	0.80	0.69	5.76	3.11	3.18	3.20	4.00	5.71	2.30	2.05	4.05
13	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	1.73	4.47	0.35	0.00	1.98	2.27	2.03	0.00	14.74	2.68	1.97	3.18	2.14	2.05	10.38	3.07	10.74	2.39	5.94	0.57	3.50	2.23	0.00	6.66	0.30	2.60	0.38	0.34	1.10
14	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	8.92	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	15.68	0.00	5.85	3.37	1.24	0.00	8.37	3.82	9.68	0.00	0.00	0.00	3.21	1.85	0.00	11.54	0.00	5.41	2.53	0.00	0.00
15	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	E2_Da	NovelBoundary	0	0.00	18.23	1.54	0.00	0.00	3.07	0.00	0.00	8.98	1.92	0.00	5.18	0.00	0.00	16.94	3.37	6.26	0.00	0.00	3.72	8.62	2.19	0.00	3.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	Ix	Intron	0	2.24	4.68	0.25	0.00	1.46	1.95	1.06	0.28	7.42	0.86	1.16	3.55	4.83	1.72	8.80	3.10	6.59	1.01	1.91	1.53	3.84	0.40	0.41	5.79	0.21	1.29	0.27	0.85	1.30
19	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.93	5.06	0.33	0.00	0.98	1.37	1.01	0.37	8.35	1.16	1.43	4.07	5.23	1.76	8.83	3.72	8.51	0.96	1.92	1.77	3.85	0.54	0.54	6.88	0.14	1.10	0.37	0.98	1.13
20	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	3.20	3.57	0.00	0.00	2.91	3.69	1.20	0.00	4.67	0.00	0.35	2.03	3.66	1.62	8.78	1.27	0.89	1.15	1.91	0.82	3.83	0.00	0.00	2.57	0.43	1.87	0.00	0.49	1.80
21	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.00	4.17	0.00	0.00	0.00	1.69	2.92	0.00	3.44	0.00	4.40	1.39	0.00	2.19	9.37	0.00	1.04	0.00	16.18	0.00	9.75	1.94	0.00	0.00	0.00	3.35	0.00	1.93	0.00
22	ER3a	ExonRegion	0	0.82	1.23	0.00	0.00	0.00	0.53	0.77	0.00	3.87	0.00	0.00	1.18	1.24	1.38	3.54	0.95	2.86	0.00	0.00	0.00	4.36	0.69	0.00	1.65	0.00	0.00	0.00	0.00	2.30