Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 CCDC29 Gene 0 1.96 2.14 1.75 0.86 1.14 0.69 0.80 2 299450 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 333394 Transcript 0 0.38 0.43 0.32 0.00 1.11 0.00 0.07 4 340460 Transcript 0 3.13 2.58 3.01 2.03 1.64 0.59 2.11 5 ER1a ExonRegion 0 0.13 0.00 0.12 0.07 0.39 0.00 0.02 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 ER2a ExonRegion 0 0.73 0.45 0.43 1.22 0.49 0.06 0.76 8 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 1.55 0.00 1.27 0.00 0.00 0.00 9 E2a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER3a ExonRegion 0 1.65 3.56 1.59 0.41 0.52 1.16 0.35 11 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E3a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER4a ExonRegion 0 2.00 2.05 1.61 1.28 0.28 1.01 0.32 14 E4a_E5a KnownJunction 0 1.77 1.21 3.75 1.03 0.00 0.00 0.00 15 ER5a ExonRegion 0 3.07 3.15 3.69 0.05 1.18 1.03 1.23 16 E5_Da NovelBoundary 0 25.59 3.89 9.51 1.33 90.87 1.26 13.69 17 ER5b ExonRegion 0 0.77 0.86 0.65 0.00 2.23 0.00 0.14 18 ER6a ExonRegion 0 2.37 0.00 0.88 1.08 0.18 0.88 1.92 19 E6a_E7a KnownJunction 0 5.69 4.15 6.12 1.68 2.01 1.66 3.41 20 ER7a ExonRegion 0 3.70 2.61 3.95 2.75 0.72 0.98 3.70 21 E7a_E8a KnownJunction 0 3.27 6.02 4.81 4.33 0.88 0.00 2.18 22 ER8a ExonRegion 0 3.75 2.70 2.31 2.32 6.08 0.00 1.46