Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	FAM135B	Gene	0	0.24	0.03	0.03	0.00	0.37	0.03	0.00
2	160713	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
3	395297	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0
4	395295	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	276737	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.00	0.00
7	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	ER3b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00
13	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00
15	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER5a	ExonRegion	0	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
17	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
18	ER6a	ExonRegion	0	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
19	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER7a	ExonRegion	0	0.34	0.61	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
21	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	1.10	0.69	0.00	0.00	0.00	0.00
22	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.62	0.31	0.00	0.57	0.00	0.00
23	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.01	0.00	0.00
24	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.33	0.00	0.07	0.00	0.00
25	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00	0.00
27	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	2.35	0.00	0.00
28	ER11a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.00	0.00
29	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER13a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E13a_E14a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
34	ER14a	ExonRegion	0	0.32	0.00	0.00	0.00	0.35	0.09	0.00
35	E14a_E15a	KnownJunction	0	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	E14a_E15b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
37	ER15a	ExonRegion	0	0.46	0.00	0.00	0.00	0.39	0.00	0.00
38	E15_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
39	ER15b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.00	0.00
40	E15a_E16a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.96	0.00	0.00
41	ER16a	ExonRegion	0	0.43	0.00	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00
42	E16a_E17a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
43	ER17a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.73	0.00	0.00
44	E17a_E18a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00	0.00
45	ER18a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00
46	E18a_E19a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
47	ER19a	ExonRegion	0	0.19	0.00	0.00	0.00	0.74	0.00	0.00
48	E19a_E20a	KnownJunction	0	0.97	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
49	ER20a	ExonRegion	0	0.33	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	E20a_E21a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
51	ER21a	ExonRegion	0	0.34	0.00	0.00	0.00	0.48	0.00	0.00
52	E21_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
53	ER21b	ExonRegion	0	0.26	0.00	0.05	0.00	0.38	0.00	0.00