Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	CHST12	Gene	0	6.99	9.42	8.90	6.98	32.72	26.27	24.03
2	397008	Transcript	0	0.02	0.13	0.06	0.07	0.22	0.10	0.17
3	258711	Transcript	0	0.98	2.58	0.93	1.23	3.09	0.99	3.42
4	397009	Transcript	0	0.45	0.13	0.07	1.14	1.30	1.94	0.62
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1_Da	NovelBoundary	0	249.00	256.59	168.46	247.64	57.12	280.78	124.94
7	E1a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	I1	Intron	0	0.65	0.34	1.11	0.43	7.51	0.37	3.22
9	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	2.16	0.00	2.42	1.25	5.48	0.00	8.10
10	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	5.39	0.05	4.40	1.61	27.14	0.96	13.03
11	I1_SR4	SilentIntronRegion	0	4.31	1.26	7.50	4.04	19.95	1.16	14.39
12	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	4.47	2.64	7.99	1.85	16.81	6.24	11.49
13	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	9.32	6.67	4.21	17.54	0.81	5.18	0.65
14	I1_AR6	ActiveIntronRegion	1	1.16	8.18	1.04	2.36	0.00	0.33	0.00
15	I1_AR8	ActiveIntronRegion	0	2.12	5.89	2.07	14.14	0.00	6.35	0.40
16	ER2a	ExonRegion	0	0.12	0.60	0.00	1.25	0.78	0.32	1.41
17	E2a_E3b	KnownJunction	0	1.85	4.57	1.85	1.22	5.39	1.66	5.42
18	ER2b	ExonRegion	0	0.77	3.64	0.74	1.25	3.97	1.23	2.96
19	E2b_E3b	KnownJunction	0	0.90	0.00	0.00	1.38	1.18	2.73	0.72
20	ER2c	ExonRegion	0	0.00	0.26	0.15	0.89	1.42	1.14	0.53
21	ER3a	ExonRegion	0	0.06	0.40	0.17	0.21	0.67	0.31	0.51
22	ER3b	ExonRegion	0	9.33	13.23	12.15	9.33	45.42	37.59	33.83
23	E3_Da	KnownBoundary	0	1.95	0.00	9.94	1.52	16.74	5.98	10.99
24	ER3c	ExonRegion	0	2.26	1.05	2.17	2.05	5.56	1.36	2.67
25	IG23	Intergenic	0	0.51	0.61	1.97	0.62	9.05	1.17	1.99
26	IG23_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.58	0.60	2.32	0.46	10.57	1.08	2.01
27	IG23_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.87	0.73	1.72	0.54	8.07	1.44	2.23
28	IG23_SR2	SilentIntergenicRegion	0	0.11	0.51	1.80	0.88	8.26	1.01	1.75