Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 BAI3 Gene 0 0.02 0.03 0.44 0.49 3.97 0.19 0.00 2 370598 Transcript 0 0.10 0.00 0.52 0.15 2.74 0.10 0.00 3 238918 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.47 0.75 1.37 0.59 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.86 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.47 0.00 4.02 0.00 0.00 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.94 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.62 0.00 0.34 0.16 7.09 0.00 0.00 9 ER3b ExonRegion 0 0.14 0.00 1.15 1.24 6.02 0.00 0.00 10 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 7.65 0.00 0.00 11 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.46 1.29 5.98 0.00 0.00 12 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 2.68 5.51 0.00 0.00 13 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.45 5.00 0.00 0.00 14 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 8.41 0.00 0.00 15 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.00 7.30 0.56 0.00 16 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.38 2.97 0.00 0.00 17 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.94 5.27 0.65 0.00 18 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.60 5.03 1.13 0.00 19 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.36 5.09 0.48 0.00 20 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.31 0.00 0.00 21 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.64 0.00 0.00 22 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.00 2.24 0.00 0.00 23 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.48 0.00 2.13 0.00 0.00 24 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.18 0.00 0.00 25 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.26 0.04 3.04 0.48 0.00 26 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.46 0.00 0.00 27 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.25 4.41 0.92 0.00 28 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 7.65 1.47 0.00 29 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.87 2.88 0.27 0.00 30 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.00 0.00 0.00 31 ER14a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.23 0.00 3.21 0.02 0.00 32 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.39 0.00 2.86 0.00 0.00 33 ER15a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.90 0.00 4.85 1.18 0.00 34 E15a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.96 0.00 0.00 35 ER16a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.14 0.00 6.28 0.00 0.00 36 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 1.94 0.00 2.95 0.00 0.00 37 ER17a ExonRegion 0 0.00 0.44 0.82 0.00 3.04 0.00 0.00 38 E17a_E18a KnownJunction 0 0.00 1.23 0.00 0.00 7.40 0.00 0.00 39 ER18a ExonRegion 0 0.00 1.04 0.77 0.00 8.91 0.00 0.00 40 E18a_E19a KnownJunction 0 0.00 1.52 0.55 0.00 4.47 0.00 0.00 41 ER19a ExonRegion 0 0.00 0.32 0.52 0.00 5.19 0.00 0.00 42 E19a_E20a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 5.62 0.00 0.00 43 ER20a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.02 0.00 6.95 0.90 0.00 44 E20a_E21a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.84 0.00 0.00 45 ER21a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.21 0.62 0.00 46 E21a_E22a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 6.25 0.00 0.00 47 ER22a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.42 0.00 4.28 0.00 0.00 48 E22a_E23a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.89 0.00 5.21 0.00 0.00 49 ER23a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.33 0.00 5.00 0.00 0.00 50 E23a_E24a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.22 0.00 0.00 51 ER24a ExonRegion 0 0.00 0.00 1.02 0.00 5.73 0.00 0.00 52 E24a_E25a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.78 0.00 7.93 0.00 0.00 53 ER25a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.27 0.00 4.72 0.00 0.00 54 E25a_E26a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.68 0.00 5.21 0.00 0.00 55 ER26a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.54 0.00 5.57 0.00 0.00 56 E26a_E27a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.73 0.00 2.31 0.00 0.00 57 ER27a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.06 0.00 2.56 0.00 0.00 58 E27a_E28a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.43 0.00 0.00 59 ER28a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.68 0.00 3.32 0.00 0.00 60 E28a_E29a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.83 0.00 2.35 0.00 0.00 61 ER29a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.19 0.53 3.48 0.00 0.00 62 E29a_E30a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.63 1.18 0.00 0.00 63 ER30a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 1.00 3.15 0.00 0.00 64 E30a_E31a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.40 0.00 0.00 65 ER31a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.29 0.50 1.50 0.00 0.00 66 E31a_E32a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.85 1.68 0.00 0.00 0.00 67 ER32a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.28 0.17 1.52 0.00 0.00 68 ER32b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00