Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	HCG9	Gene	0	0.72	0.96	1.00	2.40	0.98	5.90	0.00
2	404219	Transcript	0	0.23	0.15	0.88	1.19	0.11	4.11	0.00
3	376800	Transcript	0	0.67	0.26	0.28	0.27	2.20	3.65	0.00
4	396615	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.30	0.93	0.00	0.00	2.35	0.00
6	ER1b	ExonRegion	0	0.66	1.82	1.48	3.83	0.10	7.55	0.00
7	E1_Da	KnownBoundary	0	1.85	7.80	0.82	2.93	0.00	10.69	2.29
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER1c	ExonRegion	0	0.46	0.00	0.83	2.39	0.22	5.87	0.00
10	I1	Intron	0	0.67	2.80	0.89	2.88	0.65	8.17	0.32
11	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	0.68	2.80	0.89	2.88	0.65	8.18	0.32
12	E2_Aa	NovelBoundary	0	0.00	1.37	3.03	0.00	0.00	13.53	0.70
13	ER2a	ExonRegion	0	0.61	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	0.00
14	E2_Da	NovelBoundary	0	4.01	3.78	4.83	5.66	0.00	15.30	0.00
15	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	2.44	0.00
16	I2	Intron	0	0.33	0.78	1.35	1.86	0.23	9.89	0.14
17	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	0.33	0.78	1.36	1.87	0.23	9.94	0.14
18	E3_Aa	NovelBoundary	0	0.87	2.42	0.85	1.68	0.00	11.52	0.89
19	ER3a	ExonRegion	0	1.34	0.53	0.57	0.54	4.40	4.85	0.00
20	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00