Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	PCDHA4	Gene	0	0.78	0.34	1.28	0.00	8.55	0.14	1.46
2	394619	Transcript	0	0.09	0.00	0.64	0.00	5.07	0.00	1.39
3	356878	Transcript	0	0.00	0.00	0.20	0.00	1.70	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	0.62	0.00	2.03	0.00	15.34	0.00	0.34
5	ER1b	ExonRegion	0	1.71	0.75	2.78	0.00	18.22	0.30	3.02
6	E1_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.83	0.00	1.94	0.00	0.00
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.47	0.00	9.43	0.00	4.59
8	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.20	0.00	1.70	0.00	0.00
9	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	9.18	0.00	0.00
10	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.35	0.56	1.87	0.57	16.99	0.56	0.31
11	Ix	Intron	0	0.24	0.10	0.98	0.30	11.04	0.19	0.28
12	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.58	0.00	0.72	0.17	17.31	0.00	0.19
13	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.50	0.41	1.53	0.33	21.27	0.17	0.40
14	Ix	Intron	0	0.20	0.22	2.15	0.50	19.46	0.20	0.40
15	Ix_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.68	0.00	16.38	0.00	0.00
16	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.23	0.43	2.36	0.00	22.02	0.00	0.00
17	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.38	2.17	0.39	15.82	0.19	0.00
18	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	0.13	0.00	0.89	0.00	14.69	0.00	0.14
19	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.52	0.26	2.07	0.82	16.83	0.00	0.97
20	Ix_SR3	SilentIntronRegion	0	0.31	0.91	2.18	0.17	23.25	0.00	0.25
21	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.35	0.00	4.66	0.53	32.59	0.00	1.12
22	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	1.39	0.91	20.69	0.00	0.56
23	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.94	0.66	13.66	1.02	0.00
24	Ix	Intron	0	0.25	0.00	0.76	0.00	7.50	0.00	0.08
25	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	0.81	0.00	0.96	0.00	11.39	0.00	0.18
26	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	0.15	0.00	0.82	0.00	7.79	0.00	0.00
27	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	8.83	0.00	0.00
28	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.46	0.00	6.45	0.00	2.45
29	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.56	0.00	4.16	0.00	2.30
31	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.00	0.06