Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 PCDHA6 Gene 0 0.30 0.10 1.01 0.27 1.69 0.09 0.09 2 394608 Transcript 0 0.00 0.00 0.82 0.00 0.56 0.00 0.00 3 289630 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.03 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.89 0.00 0.00 5 ER1b ExonRegion 0 0.67 0.23 2.12 0.59 3.70 0.16 0.19 6 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 2.56 0.00 0.90 0.00 0.00 7 ER1c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.03 0.00 0.00 8 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 9.18 0.00 0.00 9 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.35 0.56 1.87 0.57 16.99 0.56 0.31 10 Ix Intron 0 0.24 0.10 0.98 0.30 11.04 0.19 0.28 11 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.58 0.00 0.72 0.17 17.31 0.00 0.19 12 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.50 0.41 1.53 0.33 21.27 0.17 0.40 13 Ix Intron 0 0.20 0.22 2.15 0.50 19.46 0.20 0.40 14 Ix_AR1 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 1.68 0.00 16.38 0.00 0.00 15 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.23 0.43 2.36 0.00 22.02 0.00 0.00 16 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.38 2.17 0.39 15.82 0.19 0.00 17 Ix_SR2 SilentIntronRegion 0 0.13 0.00 0.89 0.00 14.69 0.00 0.14 18 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.52 0.26 2.07 0.82 16.83 0.00 0.97 19 Ix_SR3 SilentIntronRegion 0 0.31 0.91 2.18 0.17 23.25 0.00 0.25 20 Ix_AR4 ActiveIntronRegion 0 0.35 0.00 4.66 0.53 32.59 0.00 1.12 21 Ix_AR5 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 1.39 0.91 20.69 0.00 0.56 22 Ix_AR6 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.94 0.66 13.66 1.02 0.00 23 Ix Intron 0 0.25 0.00 0.76 0.00 7.50 0.00 0.08 24 Ix_SR1 SilentIntronRegion 0 0.81 0.00 0.96 0.00 11.39 0.00 0.18 25 Ix_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.15 0.00 0.82 0.00 7.79 0.00 0.00 26 Ix_AR3 ActiveIntronRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 8.83 0.00 0.00 27 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 2.42 0.00 0.11 0.00 0.00 28 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.72 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.03 0.00