Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	PCDHGA2	Gene	0	0.95	0.19	6.89	1.20	0.79	4.43	3.85
2	394576	Transcript	0	0.30	0.00	1.89	0.00	0.65	1.98	0.45
3	305759	Transcript	0	0.98	0.96	10.06	1.01	2.17	0.33	4.05
4	ER1a	ExonRegion	0	2.12	0.00	2.15	0.00	0.31	2.20	1.65
5	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	3.71	0.00	0.00	4.10	1.33
6	ER1b	ExonRegion	0	1.73	0.33	12.92	2.33	1.34	8.43	7.36
7	E1_Da	KnownBoundary	0	0.95	3.26	13.77	0.00	2.35	1.55	2.25
8	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	5.46	0.00	0.00	6.73	1.15
9	ER1c	ExonRegion	0	0.98	0.96	10.06	1.01	2.17	0.33	4.05
10	E1_Db	NovelBoundary	0	3.04	1.63	14.33	0.00	0.00	1.66	4.54
11	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	1.37	0.00	10.24	0.00	0.00	1.50	6.30
12	I1_AR4	ActiveIntronRegion	0	2.40	0.00	12.43	0.00	0.00	2.45	5.87
13	I1_AR5	ActiveIntronRegion	0	2.38	0.00	14.47	0.00	2.21	2.45	3.86
14	I1_AR6	ActiveIntronRegion	0	3.07	0.00	16.66	0.00	2.43	2.45	5.40
15	I1_AR7	ActiveIntronRegion	0	3.07	0.00	16.77	0.00	2.43	3.68	6.07
16	I1_SR1	SilentIntronRegion	0	2.54	0.45	14.14	0.00	1.09	1.91	4.10
17	I1_AR9	ActiveIntronRegion	0	2.25	0.00	11.40	0.00	0.26	1.13	4.65
18	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.67	0.46	1.38	0.18	7.53	1.36	3.08
19	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	1.42	0.24	2.74	0.28	8.97	2.75	1.73
20	Ix	Intron	0	2.72	0.00	3.26	0.25	8.43	0.00	1.49
21	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	2.73	0.00	3.27	0.25	8.44	0.00	1.49
22	Ix	Intron	0	3.10	0.49	2.32	0.29	8.98	0.57	6.94
23	Ix_AR4	ActiveIntronRegion	0	6.90	1.12	3.59	0.34	23.92	0.82	16.42
24	Ix	Intron	0	9.42	2.41	5.80	1.21	9.82	1.75	4.15
25	Ix_AR3	ActiveIntronRegion	0	36.34	10.58	15.45	2.79	5.34	2.27	14.61
26	Ix_AR5	ActiveIntronRegion	0	7.53	2.86	11.72	3.89	18.48	6.03	8.10
27	Ix_AR6	ActiveIntronRegion	0	7.88	2.00	3.05	0.60	35.02	2.02	2.69
28	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	4.39	0.00	3.17	3.26	0.32
29	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
30	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.19	0.00	1.07	1.58	0.00
31	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
32	Ix_SR1	SilentIntronRegion	0	4.42	6.66	5.44	8.20	0.24	1.75	2.43
33	Ix_SR2	SilentIntronRegion	0	9.54	6.97	7.90	8.59	0.67	3.93	2.89
34	Ix_AR2	ActiveIntronRegion	0	5.19	5.98	7.20	8.86	0.19	4.17	3.53
35	ER4a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00