Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 RUFY4 Gene 0 0.01 0.05 0.00 0.05 0.97 0.24 0.00 2 344321 Transcript 0 0.00 0.09 0.00 0.00 0.70 0.12 0.00 3 374155 Transcript 0 0.02 0.00 0.00 0.04 0.54 0.07 0.00 4 IG39_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 0.09 2.27 1.12 8.91 0.42 45.02 0.00 5 IG39_AR6 ActiveIntergenicRegion 0 2.36 2.38 2.69 5.75 0.00 53.02 0.00 6 IG39_AR8 ActiveIntergenicRegion 0 0.18 0.00 0.00 1.21 0.26 20.78 0.00 7 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.30 0.00 0.00 8 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.00 0.00 9 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.29 0.00 0.00 10 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 12 E3a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.24 0.39 0.00 15 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.99 0.00 0.00 16 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.40 0.00 0.00 0.98 0.30 0.00 17 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 1.50 0.00 0.00 2.88 1.66 0.00 18 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.30 0.00 0.00 1.48 0.45 0.00 19 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.84 0.00 0.00 21 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.51 0.00 0.00 23 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.06 0.00 0.00 24 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.60 0.00 0.00 25 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.03 0.00 0.00 26 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.38 0.00 0.00 27 E11_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 E11a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 29 ER11b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 30 E11b_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 33 ER13a ExonRegion 0 0.00 0.14 0.00 0.15 1.42 0.43 0.00 34 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.00 0.00 35 ER14a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.78 0.00 0.00 36 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.31 0.00 0.00 37 ER15a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.76 0.00 0.00 38 E15a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.11 0.00 0.00 39 ER16a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.37 0.00 0.00 40 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 E16a_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 42 ER17a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.36 0.00 0.00 43 ER18a ExonRegion 0 0.09 0.00 0.00 0.14 1.25 0.30 0.00