Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	HOXD9	Gene	0	0.00	0.04	0.05	0.18	0.00	2.85	0.19
2	249499	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	1.48	0.11
3	392535	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.14	0.00
5	E1_Ab	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	1.41	0.00	2.89	0.00
6	ER1b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	2.64	0.00
7	E1_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E1a_E1c	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	E1_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER1c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER1d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.00
12	E1_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
13	E1b_E1d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	E1_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	ER1e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.41	0.00
16	ER1f	ExonRegion	0	0.00	0.27	0.15	0.00	0.00	1.93	0.00
17	E1c_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.04	0.00
18	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.21	0.78	0.00	3.43	0.56
19	E2_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.21	1.56
20	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	5.35	0.44