Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	ERMN	Gene	0	0.22	0.07	0.25	0.12	0.96	0.16	0.48
2	397283	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.00	0.00
3	410096	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
4	259055	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0
5	409216	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	409395	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	409925	Transcript	0	0.25	0.15	0.02	0.00	0.85	0.30	0.08
8	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.00	0.00
9	E1a_E2d	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
11	ER2b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.46	0.62	0.00	0.00	0.56
12	E2_Ac	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.78	1.68	0.00	0.00	0.60
13	ER2c	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.44	0.30	0.55	0.00	0.46
14	E2_Ad	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
15	E2_Ae	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89
16	ER2d	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.72
17	ER2e	ExonRegion	0	0.53	0.00	0.40	0.00	0.60	0.00	0.31
18	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.92	0.00	0.00	0.00	2.17	0.00	0.00
19	E2a_E3b	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
20	ER3a	ExonRegion	0	1.18	0.00	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00
21	E3_Ab	KnownBoundary	0	1.03	0.00	0.00	0.00	0.85	0.00	0.00
22	ER3b	ExonRegion	0	0.82	0.00	0.00	0.00	0.28	0.00	0.00
23	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
24	E3a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	E4_Aa	NovelBoundary	0	126.34	77.71	98.61	93.68	47.79	110.68	58.16
26	ER4a	ExonRegion	0	1.43	0.65	0.25	0.77	11.57	1.38	0.38
27	E4_Da	NovelBoundary	0	19.41	8.07	24.14	7.23	20.17	1.45	13.16
28	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	E4_Db	NovelBoundary	0	4.07	19.73	1.91	7.31	3.78	12.22	0.00
30	E4b_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER4b	ExonRegion	0	0.50	0.29	0.05	0.00	1.70	0.59	0.16
32	ER5a	ExonRegion	0	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.50
33	E5_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.89
34	ER5b	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.94	0.00	1.19
35	E5_Db	KnownBoundary	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.04	0.00	0.70
36	ER5c	ExonRegion	0	0.40	0.00	0.08	0.14	1.07	0.00	0.63
37	E5_Dc	KnownBoundary	0	0.93	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.62
38	ER5d	ExonRegion	0	0.08	0.08	0.31	0.08	0.55	0.20	0.51
39	ER5e	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
40	IG11	Intergenic	0	0.02	0.00	2.70	1.53	0.33	0.22	33.37
41	IG11_AR5	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	0.87	1.00	0.12	0.28	17.88
42	IG11_SR3	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	1.43	0.28	0.16	0.00	16.75
43	IG11_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	0.00	0.00	1.58	1.30	0.34	0.25	17.60
44	IG11_AR2	ActiveIntergenicRegion	0	0.02	0.00	3.13	1.80	0.03	0.23	34.02
45	IG11_SR1	SilentIntergenicRegion	0	0.00	0.00	4.26	0.80	0.59	0.00	19.80
46	IG11_AR1	ActiveIntergenicRegion	0	0.08	0.00	5.51	2.89	1.67	0.39	86.87