Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	C2orf48	Gene	0	1.18	0.24	0.88	0.10	23.17	0.00	0.11
2	381786	Transcript	0	0.23	0.05	0.17	0.02	15.56	0.00	0.02
3	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.00	0.00
4	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
5	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	35.42	0.00	0.00
6	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	29.09	0.00	0.00
7	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	16.14	0.00	0.00
8	E3_Da	NovelBoundary	0	0.00	1.63	0.00	0.00	19.09	0.00	0.00
9	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00
10	I3	Intron	0	0.14	0.06	0.04	0.04	9.79	0.04	0.14
11	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.09	0.00	0.05	0.00	8.52	0.00	0.05
12	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.07	0.00	0.00	0.00	10.68	0.00	0.00
13	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	0.23	0.00	0.00	0.00	8.07	0.00	0.10
14	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.20	0.00	0.09	0.16	10.13	0.00	0.17
15	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	0.15	0.15	0.05	0.05	10.63	0.10	0.22
16	I3_SR1	SilentIntronRegion	0	0.01	0.00	0.00	0.23	7.70	0.00	0.12
17	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	0.33	0.00	0.10	0.00	11.15	0.00	0.20
18	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	0.16	0.09	0.12	0.04	8.11	0.08	0.12
19	I3_AR3	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	11.26	0.00	0.67
20	I3_AR4	ActiveIntronRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	9.72	0.00	0.67
21	I3_AR5	ActiveIntronRegion	0	0.72	0.00	0.55	0.00	15.51	0.00	0.44
22	I3_SR7	SilentIntronRegion	0	0.09	0.00	0.03	0.00	8.30	0.00	0.15
23	I3_AR9	ActiveIntronRegion	0	0.28	0.00	0.24	0.00	14.37	0.00	0.12
24	I3_SR8	SilentIntronRegion	0	0.09	0.00	0.08	0.15	10.32	0.00	0.53
25	ER4a	ExonRegion	0	1.58	0.32	1.17	0.13	27.11	0.00	0.14