Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 TPO Gene 0 0.13 0.06 0.13 0.00 1.64 0.26 0.05 2 382269 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 329066 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 4 337415 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 5 345913 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 6 346956 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 7 382201 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 349624 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 9 382198 Transcript 0 0 0 0 0 0 0 0 10 308422 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 11 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.50 0.00 0.00 12 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 13 E1b_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 14 ER1b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 15 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 16 ER2b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 17 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 18 ER3a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 19 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 20 ER4a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.49 0.00 0.00 21 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 22 ER5a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.05 0.00 0.00 23 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 24 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER7a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.18 0.00 0.00 27 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 28 I7_AR2 ActiveIntronRegion 0 0.65 0.00 0.00 0.00 11.14 0.00 0.00 29 ER8a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.07 0.00 1.80 0.88 0.00 30 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.72 0.00 0.00 0.00 0.00 31 E8a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER9a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.12 0.00 0.75 0.00 0.00 33 E9_Ab KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 34 ER9b ExonRegion 0 0.00 0.00 0.17 0.00 0.61 0.00 0.00 35 E9_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 36 E9a_E9c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 37 E9_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 38 ER9c ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 39 ER9d ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.56 0.00 0.00 40 E9b_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 41 ER10a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.99 0.07 0.13 42 E10_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.40 0.00 0.64 43 ER10b ExonRegion 0 0.32 0.00 0.00 0.00 1.24 0.00 0.23 44 E10b_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 45 E10b_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 46 ER11a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.65 0.00 0.00 47 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 48 ER12a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.38 0.00 1.87 0.00 0.19 49 E12a_E13a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.69 0.00 0.00 0.00 0.00 50 ER13a ExonRegion 0 0.38 0.00 0.06 0.00 1.60 0.00 0.27 51 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 52 ER14a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.07 0.00 0.00 53 E14a_E15a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 54 E14a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 55 ER15a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 56 E15a_E16a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 57 ER16a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.82 0.00 0.00 58 E16a_E17a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 59 E16a_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 60 ER17a ExonRegion 0 0.45 0.00 0.80 0.00 1.28 0.71 0.00 61 E17a_E18a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 62 ER18a ExonRegion 0 0.00 0.79 0.68 0.00 6.39 0.09 0.00 63 E18_Da KnownBoundary 0 0.73 1.63 0.69 0.00 6.09 0.00 0.00 64 ER18b ExonRegion 0 0.86 0.57 0.46 0.00 5.74 2.23 0.00 65 IG8_SR6 SilentIntergenicRegion 0 0.74 0.16 0.00 0.25 2.20 11.25 0.71 66 IG8_AR12 ActiveIntergenicRegion 0 3.30 0.31 0.52 0.32 8.58 0.32 0.86