Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	TBX1	Gene	0	0.42	0.26	0.53	0.20	0.22	1.96	1.55
2	332710	Transcript	0	0.06	0.19	0.07	0.00	0.02	2.59	0.46
3	329705	Transcript	0	1.20	0.14	1.68	0.88	0.77	0.29	5.33
4	359500	Transcript	0	0.00	0.19	0.11	0.00	0.17	0.39	1.58
5	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
7	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
9	ER3a	ExonRegion	0	0.08	0.41	0.14	0.00	0.00	1.67	0.00
10	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.90	1.47	0.00	0.00	0.00	4.05	0.00
11	ER4a	ExonRegion	0	0.26	0.30	0.50	0.00	0.00	6.44	0.00
12	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.02	0.00
13	ER5a	ExonRegion	0	0.59	0.00	0.00	0.00	0.00	5.28	0.13
14	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00	4.98	0.89
15	ER6a	ExonRegion	0	0.80	0.00	0.66	0.00	0.00	5.90	0.45
16	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.65	0.00	0.00	0.00	0.00	5.57	0.69
17	ER7a	ExonRegion	0	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	4.94	0.17
18	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	7.80	0.00
19	ER8a	ExonRegion	0	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	5.15	0.27
20	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	3.97	0.89
21	E8a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
22	E8a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER9a	ExonRegion	0	0.12	0.39	0.15	0.00	0.04	1.21	0.03
24	E10_Aa	NovelBoundary	0	1.60	1.00	4.02	0.00	4.93	1.15	16.22
25	ER10a	ExonRegion	0	2.41	0.29	3.35	1.76	1.53	0.58	10.66
26	E10_Da	NovelBoundary	0	6.53	0.00	4.97	0.00	1.08	1.61	12.50
27	I10	Intron	0	2.09	0.99	3.62	1.01	0.58	0.80	9.00
28	I10_SR1	SilentIntronRegion	0	2.09	0.99	3.62	1.01	0.58	0.80	9.02
29	E11_Aa	NovelBoundary	0	2.87	0.00	1.15	2.71	0.00	1.61	11.75
30	ER11a	ExonRegion	0	0.00	0.77	0.43	0.00	0.69	1.55	6.30
31	E11_Da	NovelBoundary	0	1.03	0.00	3.00	3.22	0.00	1.53	7.34
32	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
33	E12_Aa	NovelBoundary	0	4.71	1.16	3.03	2.71	0.00	0.00	8.61
34	ER12a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01