Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 NPHS1 Gene 0 4.54 2.12 2.11 1.64 5.24 2.22 0.88 2 378910 Transcript 0 0.52 0.01 0.00 0.00 1.29 0.00 0.00 3 353632 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 4 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.06 0.00 0.00 5 E1a_E2a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 ER2a ExonRegion 0 1.25 0.01 0.00 0.44 0.93 1.29 0.00 7 E2a_E3a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 8 ER3a ExonRegion 0 0.47 1.46 0.00 0.00 2.61 2.23 0.00 9 E3a_E4a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.92 0.00 0.00 10 ER4a ExonRegion 0 2.53 0.00 0.00 0.73 0.83 0.72 0.00 11 E4a_E5a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.12 0.00 0.00 12 ER5a ExonRegion 0 0.73 1.13 0.00 0.00 3.95 1.08 0.00 13 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 1.91 2.68 0.00 14 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.91 2.16 1.72 0.00 15 E6a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 3.20 3.32 0.00 16 ER7a ExonRegion 0 1.22 1.44 0.00 0.03 3.28 1.55 0.00 17 E7a_E8a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 4.15 0.00 0.00 18 ER8a ExonRegion 0 1.68 0.00 0.00 0.97 2.96 0.00 0.30 19 E8a_E9a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.25 3.09 0.00 0.00 20 ER9a ExonRegion 0 1.35 0.00 0.00 0.12 2.97 1.76 0.00 21 E9a_E10a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 1.54 1.96 0.00 0.00 22 ER10a ExonRegion 0 2.55 1.27 0.00 0.00 2.38 1.04 0.00 23 E10a_E11a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 2.05 1.47 0.00 24 ER11a ExonRegion 0 0.31 0.74 0.00 0.76 0.28 0.28 0.00 25 E11a_E12a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 26 ER12a ExonRegion 0 0.69 1.13 0.28 1.01 1.84 0.00 0.00 27 E12a_E13a KnownJunction 0 1.74 1.39 0.00 0.00 1.15 0.00 0.00 28 ER13a ExonRegion 0 1.55 1.21 0.75 1.12 1.63 1.41 0.00 29 E13a_E14a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.56 2.63 4.50 0.00 0.00 30 ER14a ExonRegion 0 3.82 0.51 0.33 0.25 1.51 0.54 0.00 31 E14a_E15a KnownJunction 0 0.70 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 32 ER15a ExonRegion 0 1.40 0.69 1.10 1.32 1.17 0.97 0.00 33 E15a_E16a KnownJunction 0 1.77 0.00 0.00 0.00 3.50 1.66 0.00 34 ER16a ExonRegion 0 1.53 1.28 0.00 0.00 2.14 1.66 0.00 35 E16a_E17a KnownJunction 0 0.63 0.00 0.00 0.00 1.08 0.00 0.00 36 ER17a ExonRegion 0 1.93 0.00 0.00 0.78 1.95 1.17 0.00 37 E17a_E18a KnownJunction 0 5.17 0.00 0.00 0.00 0.00 2.73 0.00 38 ER18a ExonRegion 0 6.31 0.00 0.50 0.55 2.88 1.64 0.00 39 E18a_E19a KnownJunction 0 4.59 0.00 0.00 0.00 2.24 1.66 0.00 40 ER19a ExonRegion 0 3.05 0.00 0.14 0.76 2.70 2.83 0.33 41 E19a_E20a KnownJunction 0 0.65 0.00 0.89 2.98 5.30 5.95 0.00 42 ER20a ExonRegion 0 5.13 0.63 0.87 0.93 3.77 3.48 0.67 43 E20a_E21a KnownJunction 0 1.34 2.44 0.00 2.38 3.04 3.75 0.00 44 ER21a ExonRegion 0 1.37 1.62 0.00 0.18 1.66 0.84 0.00 45 E21a_E22a KnownJunction 0 3.47 0.00 0.79 0.00 2.01 0.00 0.00 46 ER22a ExonRegion 0 2.23 1.21 0.00 0.00 2.01 2.28 0.00 47 E22a_E23a KnownJunction 0 3.20 1.58 0.00 0.00 1.04 1.66 0.00 48 ER23a ExonRegion 0 1.47 1.00 0.00 0.00 1.49 0.90 0.00 49 E23a_E24a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 50 E23a_E25a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 51 ER24a ExonRegion 0 0.93 0.02 0.00 0.00 0.90 0.00 0.00 52 E24a_E25a KnownJunction 0 0.62 0.00 0.00 0.00 2.07 0.00 0.00 53 ER25a ExonRegion 0 0.28 1.21 0.00 0.00 0.94 0.00 0.00 54 ER26a ExonRegion 0 1.56 0.78 0.00 0.00 1.11 0.00 0.00 55 E26a_E27a KnownJunction 0 0.65 0.00 0.00 0.00 2.35 0.00 0.00 56 ER27a ExonRegion 0 2.13 0.58 0.00 0.00 0.42 0.00 0.00 57 E27a_E28a KnownJunction 0 1.37 1.63 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 58 ER28a ExonRegion 0 2.01 3.68 0.18 0.00 2.56 1.68 0.00 59 E28a_E29a KnownJunction 0 3.44 1.00 0.88 0.00 3.23 2.25 0.00 60 ER29a ExonRegion 0 18.12 9.47 12.31 7.96 22.39 7.51 5.19