Order SeqName SeqType IsAE Lum_Epi Lum_Epi2 Myo_Epi Myo_Epi2 hESCs StemLike vHMECs 1 ZNF599 Gene 0 0.93 0.57 1.70 0.32 4.23 1.18 2.63 2 392231 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 3 379196 Transcript 0 0.00 0.02 0.61 2.55 0.87 0.00 1.48 4 329285 Transcript 0 1.42 0.68 1.57 0.58 3.27 1.03 4.15 5 392229 Transcript 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 6 IG50_AR5 ActiveIntergenicRegion 0 1.47 0.00 0.91 0.00 10.04 0.00 1.46 7 IG50_SR4 SilentIntergenicRegion 0 0.60 0.00 1.38 0.00 8.47 0.00 1.01 8 IG50_AR1 ActiveIntergenicRegion 0 0.60 0.45 0.80 0.00 9.46 0.00 1.08 9 ER1a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 10 ER2a ExonRegion 0 0.00 0.07 0.04 0.00 0.00 0.00 0.07 11 ER3a ExonRegion 0 1.81 1.36 1.65 1.17 3.74 2.07 4.36 12 E3a_E4a KnownJunction 0 1.03 0.00 1.48 0.00 2.79 0.00 3.94 13 ER4a ExonRegion 0 3.59 0.74 3.25 0.75 10.04 2.78 8.68 14 E4a_E5a KnownJunction 0 2.54 0.00 4.27 0.00 17.70 4.18 11.25 15 ER5a ExonRegion 0 2.49 0.92 5.74 1.74 11.85 3.05 10.03 16 E5_Da NovelBoundary 0 1.03 1.39 1.24 3.36 8.00 1.66 5.45 17 E5a_E6a KnownJunction 0 0.00 0.00 0.88 6.37 0.90 0.00 1.49 18 E5a_E7a KnownJunction 0 0.00 0.00 3.06 0.00 0.00 0.00 3.37 19 ER6a ExonRegion 0 0.00 0.00 0.91 1.27 1.73 0.00 2.87 20 ER7a ExonRegion 0 0.80 0.42 2.05 0.00 2.52 0.53 2.08 21 E7_Ab KnownBoundary 0 1.03 1.60 2.43 0.00 5.05 0.00 1.43 22 ER7b ExonRegion 0 0.91 0.12 2.26 0.09 6.57 0.90 2.88 23 E7_Da KnownBoundary 0 0.00 0.00 4.50 1.44 2.33 3.27 3.15 24 E7a_E7c KnownJunction 0 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 25 ER7c ExonRegion 0 0.03 0.00 2.67 0.85 2.77 1.33 1.74 26 E7_Ac KnownBoundary 0 0.00 0.00 2.10 0.00 5.56 0.00 1.63 27 ER7d ExonRegion 0 0.47 0.28 1.90 0.14 4.44 1.32 1.97 28 E7_Db KnownBoundary 0 3.99 31.97 15.56 46.92 30.11 24.58 26.46 29 ER7e ExonRegion 0 0.65 0.66 0.86 0.00 3.36 0.83 1.30