Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
1	DNAH2	Gene	0	0.74	0.34	1.14	0.55	0.74	0.50	0.56
2	339675	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.44	0.00
3	82259	Transcript	0	0.37	0.13	0.26	0.00	1.84	0.13	0.16
4	389173	Transcript	0	0	0	0	0	0	0	0
5	360606	Transcript	0	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
6	ER1a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.88	0.00
7	E1a_E2a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
8	ER2a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
9	E2a_E3a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
10	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.61	0.00	0.00
11	E3a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	1.84	0.00	0.00
12	ER4a	ExonRegion	0	0.34	0.00	0.00	0.55	0.74	0.54	0.00
13	E4a_E5a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
14	ER5a	ExonRegion	0	0.26	0.00	0.00	0.41	1.08	0.40	0.00
15	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
16	ER6a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.85	0.67	1.68	0.01
17	E6a_E7a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.92	0.00	0.00
18	ER7a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.22	0.40	0.55	0.00	0.62
19	E7a_E8a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.54
20	ER8a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.43	0.50	0.25
21	E8a_E9a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.62
22	E8a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
23	ER9a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.26	0.59	0.05
24	E9a_E10a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
25	ER10a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
26	E10a_E11a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
27	ER11a	ExonRegion	0	0.24	0.00	0.00	0.46	0.00	2.25	0.00
28	E11a_E12a	KnownJunction	0	0.72	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
29	ER12a	ExonRegion	0	0.57	0.00	0.68	0.73	0.00	0.00	0.00
30	E12a_E13a	KnownJunction	0	0.73	0.00	0.70	0.00	0.00	0.00	0.00
31	ER13a	ExonRegion	0	0.44	0.00	0.52	0.52	0.23	0.00	0.28
32	E13a_E14a	KnownJunction	0	1.03	0.00	0.52	1.54	0.00	0.00	0.00
33	ER14a	ExonRegion	0	0.11	0.00	0.45	0.00	0.18	0.00	0.50
34	E14_Da	KnownBoundary	0	0.00	0.00	1.42	0.00	0.00	0.00	0.62
35	E14a_E15a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
36	ER14b	ExonRegion	0	2.20	0.78	1.57	0.00	10.75	0.20	0.31
37	E14_Db	NovelBoundary	0	1491.43	1042.27	1178.48	823.62	882.42	755.27	959.19
38	ER15a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00
39	E15a_E16a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.75	0.00	0.00	0.00	0.00
40	ER16a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00
41	E16a_E17a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00
42	ER17a	ExonRegion	0	0.00	0.38	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00
43	E17a_E18a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
44	ER18a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.07	0.00	0.00	0.00	0.00
45	E18a_E19a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.53	0.00	0.00	0.00	0.00
46	ER19a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.00
47	E19a_E20a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00
48	ER20a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
49	E20a_E21a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
50	ER21a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.63	0.00	0.00	0.44	0.26
51	E21a_E22a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
52	ER22a	ExonRegion	0	0.00	0.59	0.38	0.00	0.00	0.00	0.32
53	E22a_E23a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.83	0.00	0.00	0.00	0.00
54	ER23a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.40	0.54	0.00	0.00	0.29
55	E23a_E24a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
56	ER24a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.63	0.02	0.00	0.00	0.00
57	E24a_E25a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
58	ER25a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.62	0.55	0.00	0.58	0.62
59	E25a_E26a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
60	ER26a	ExonRegion	0	0.91	0.00	0.35	0.00	0.40	0.00	0.00
61	E26a_E27a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.78	0.00	0.00	0.00	0.00
62	ER27a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.24	0.00	0.06	0.00	0.00
63	E27a_E28a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.89	0.00	0.97	0.00	0.00
64	ER28a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.51	0.00	0.40	0.00	0.00
65	E28a_E29a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.22	0.00	0.00	0.00	0.00
66	ER29a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.12	0.52	0.22	0.00	0.00
67	E29a_E30a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.15	0.00	0.00	0.00	0.00
68	ER30a	ExonRegion	0	0.42	0.00	1.47	0.00	0.59	0.00	0.37
69	E30a_E31a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.18	0.00	0.00	0.00	0.00
70	ER31a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.61	0.24
71	E31a_E32a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.68	0.00	0.00	1.66	0.00
72	ER32a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.96	0.00	0.00	0.53	0.50
73	E32a_E33a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.54	0.00	0.00	0.00	0.00
74	ER33a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00
75	E33a_E34a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
76	ER34a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.24	0.00	0.00	0.00	0.00
77	E34a_E35a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
78	ER35a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.89	0.00	0.00	0.49	0.19
79	E35a_E36a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.28	0.00	0.00	0.00	0.79
80	ER36a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.43	0.00	0.00	0.00	0.16
81	E36a_E37a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00
82	ER37a	ExonRegion	0	0.00	0.00	1.02	0.00	0.00	1.47	0.27
83	E37a_E38a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
84	ER38a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.81	0.08	0.17	1.03	0.00
85	E38a_E39a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.63	1.14	0.95	0.00	0.00
86	ER39a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.90	0.61	0.06	0.56	0.00
87	E39a_E40a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.52	0.00	0.00	1.31	0.00
88	ER40a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.53	1.24	0.26	0.71	0.34
89	E40a_E41a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
90	ER41a	ExonRegion	0	0.00	0.73	0.71	1.31	0.00	0.05	0.00
91	E41a_E42a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.69	1.38	0.00	0.00	0.00
92	ER42a	ExonRegion	0	0.00	0.42	0.53	0.98	0.00	0.00	0.00
93	E42a_E43a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.79	0.00	0.00	0.00	0.00
94	ER43a	ExonRegion	0	0.00	0.78	0.67	0.80	0.00	0.00	0.00
95	E43a_E44a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.60	0.00	0.00	0.00	0.00
96	ER44a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.43	0.69	0.00	0.00	0.00
97	E44a_E45a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
98	ER45a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.76	0.00
99	E45a_E46a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.62	0.00	0.00	1.10	0.00
100	ER46a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.46	0.00	0.00	0.51	0.00
101	E46a_E47a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.34	0.00	0.00	1.50	0.00
102	ER47a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.97	0.00	0.00	0.00	0.17
103	E47a_E48a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.69	0.00	0.00	0.00	0.89
104	ER48a	ExonRegion	0	0.00	0.00	2.04	0.00	0.00	0.00	0.69
105	E48a_E49a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.52	0.00	0.00	0.00	0.72
106	ER49a	ExonRegion	0	0.00	0.93	1.22	0.00	0.40	0.00	0.32
107	E49a_E50a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
108	ER50a	ExonRegion	0	0.94	0.82	0.92	0.95	0.37	0.80	0.22
109	E50a_E51a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	1.35	0.00	0.00	0.00
110	ER51a	ExonRegion	0	0.56	0.00	0.98	0.68	0.39	0.02	0.00
111	E51a_E52a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
112	ER52a	ExonRegion	0	0.35	0.00	0.60	0.00	0.00	0.55	0.00
113	E52a_E53a	KnownJunction	0	0.67	0.00	0.66	0.00	0.00	1.07	0.00
114	ER53a	ExonRegion	0	0.60	0.00	1.58	0.00	0.25	0.96	0.00
115	E53a_E54a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.21	0.00	1.08	0.00	0.00
116	ER54a	ExonRegion	0	0.38	0.00	1.51	0.00	0.73	0.71	0.00
117	E54a_E55a	KnownJunction	0	0.70	0.00	1.55	0.00	0.00	0.00	0.00
118	ER55a	ExonRegion	0	0.06	0.00	0.84	0.63	0.29	0.00	0.00
119	E55a_E56a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.38	0.00	0.00	0.00	0.00
120	ER56a	ExonRegion	0	0.35	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00
121	E56a_E57a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
122	ER57a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.64	0.00	0.00	0.00	0.00
123	E57a_E58a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
124	ER58a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.58	1.35	0.00	0.67	0.03
125	E58a_E59a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.50	0.00	0.00	0.00	0.54
126	ER59a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.86	0.00	0.63	0.00	0.35
127	E59a_E60a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.00
128	ER60a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.78	0.73	0.45	0.00	0.35
129	E60a_E61a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.56	0.00	1.18	0.00	0.00
130	ER61a	ExonRegion	0	1.22	0.44	1.75	1.76	1.05	0.44	0.29
131	E61a_E62a	KnownJunction	0	2.84	0.00	0.62	0.00	0.00	0.00	0.59
132	E61a_E63a	KnownJunction	0	0.73	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
133	ER62a	ExonRegion	0	1.64	0.00	0.37	0.00	0.01	0.00	0.80
134	E62a_E63a	KnownJunction	0	1.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
135	ER63a	ExonRegion	0	2.08	0.00	0.18	0.67	0.58	0.00	0.52
136	E63a_E64a	KnownJunction	0	1.60	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	0.89
137	ER64a	ExonRegion	0	1.63	0.00	1.27	0.56	0.49	0.55	1.19
138	E64a_E65a	KnownJunction	0	1.65	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.87
139	ER65a	ExonRegion	0	0.76	0.79	1.05	0.59	0.33	0.80	0.69
140	E65a_E66a	KnownJunction	0	0.00	0.00	1.44	1.41	2.35	0.00	1.73
141	ER66a	ExonRegion	0	0.35	0.00	1.63	0.16	0.27	1.12	0.94
142	E66a_E67a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
143	ER67a	ExonRegion	0	0.77	0.02	0.98	0.35	0.33	0.00	0.81
144	E67a_E68a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.72	1.68	0.00	0.00	0.00
145	ER68a	ExonRegion	0	0.48	1.79	1.15	2.87	0.28	0.00	1.42
146	E68a_E69a	KnownJunction	0	0.80	0.00	1.60	0.00	0.00	0.00	0.64
147	ER69a	ExonRegion	0	0.62	0.05	1.43	0.54	0.00	0.00	1.52
148	E69a_E70a	KnownJunction	0	0.82	0.00	0.00	1.57	0.00	0.00	2.35
149	ER70a	ExonRegion	0	1.47	0.00	2.91	3.54	0.27	0.00	3.08
150	E70a_E71a	KnownJunction	0	0.62	0.00	0.89	0.00	0.00	0.00	2.44
151	ER71a	ExonRegion	0	2.59	0.46	2.15	0.64	0.45	1.25	1.65
152	E71a_E72a	KnownJunction	0	0.83	1.23	1.85	0.00	1.18	0.00	0.00
153	ER72a	ExonRegion	0	0.40	2.21	2.33	0.66	0.28	0.00	0.38
154	E72a_E73a	KnownJunction	0	1.57	0.00	2.53	0.00	1.11	0.00	0.89
155	ER73a	ExonRegion	0	0.46	0.64	1.70	0.01	1.47	0.00	0.42
156	E73a_E74a	KnownJunction	0	0.85	0.00	0.70	0.00	1.04	0.00	1.22
157	ER74a	ExonRegion	0	2.04	0.00	1.10	0.46	1.27	0.00	0.97
158	E74a_E75a	KnownJunction	0	1.65	0.00	3.46	0.00	0.00	0.00	0.00
159	ER75a	ExonRegion	0	1.96	1.03	1.14	0.00	0.67	0.00	2.77
160	E75a_E76a	KnownJunction	0	3.49	1.63	1.80	1.30	0.00	0.00	3.70
161	ER76a	ExonRegion	0	2.12	0.78	2.91	0.98	1.56	0.00	4.32
162	E76a_E77a	KnownJunction	0	1.03	0.00	2.08	2.95	0.00	0.00	4.94
163	ER77a	ExonRegion	0	2.34	0.62	2.29	1.10	1.92	1.88	2.24
164	E77a_E78a	KnownJunction	0	0.88	0.00	3.36	1.52	0.00	0.00	4.46
165	ER78a	ExonRegion	0	1.44	1.49	2.40	1.17	0.62	0.00	1.88
166	E78a_E79a	KnownJunction	0	2.90	0.00	3.72	0.00	1.01	0.00	2.05
167	ER79a	ExonRegion	0	2.97	0.01	2.25	1.82	0.99	2.43	1.90
168	E79a_E80a	KnownJunction	0	3.45	0.00	3.81	3.01	1.13	0.00	3.30
169	ER80a	ExonRegion	0	2.71	0.96	5.26	3.12	1.70	3.38	1.27
170	E80a_E81a	KnownJunction	0	0.00	0.00	2.74	0.00	3.39	0.00	1.69
171	ER81a	ExonRegion	0	2.34	0.68	3.84	1.27	1.63	3.99	1.89
172	E81a_E82a	KnownJunction	0	0.60	1.55	3.42	1.68	3.37	0.00	1.61
173	ER82a	ExonRegion	0	3.73	0.66	2.51	0.64	1.33	3.72	2.16
174	E82a_E83a	KnownJunction	0	2.74	0.00	2.97	0.00	0.00	1.13	1.63
175	ER83a	ExonRegion	0	2.77	1.21	2.43	3.72	1.59	0.52	2.37
176	E83a_E84a	KnownJunction	0	0.60	0.00	1.32	1.03	1.91	0.00	1.50
177	ER84a	ExonRegion	0	3.03	0.40	1.44	1.60	1.56	0.00	2.15
178	E84a_E85a	KnownJunction	0	4.41	1.63	0.88	0.00	3.43	0.00	2.21
179	ER85a	ExonRegion	0	3.96	2.72	2.00	0.00	0.86	1.05	1.08
180	E85a_E86a	KnownJunction	0	3.91	1.37	0.70	0.00	0.00	0.00	2.54
181	ER86a	ExonRegion	0	2.41	1.96	2.55	0.00	2.01	0.00	0.78
182	E86_Da	NovelBoundary	0	3.07	2.89	0.55	0.00	0.00	7.88	0.00
183	E86a_E87a	KnownJunction	0	1.03	1.47	1.29	0.00	0.99	0.00	0.00
184	ER87a	ExonRegion	0	1.47	1.30	1.76	1.79	0.61	0.00	0.96
185	E87a_E88a	KnownJunction	0	0.00	1.63	0.89	3.28	0.00	0.00	0.62
186	ER88a	ExonRegion	0	1.67	1.67	1.87	1.61	0.00	0.51	0.73
187	IG32_SR3	SilentIntergenicRegion	0	3.23	7.52	2.18	1.98	0.37	3.30	0.43