Order	SeqName	SeqType	IsAE	Lum_Epi	Lum_Epi2	Myo_Epi	Myo_Epi2	hESCs	StemLike	vHMECs
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3	396205	Transcript	0	1.66	0.21	8.62	0.43	5.20	0.32	0.18
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5	320122	Transcript	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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7	IG38_AR3	ActiveIntergenicRegion	0	16.09	2.78	40.16	1.01	0.24	0.93	0.62
8	IG38_SR2	SilentIntergenicRegion	0	2.67	0.00	11.45	0.00	0.24	0.00	0.00
9	ER1a	ExonRegion	0	2.89	0.00	16.90	0.00	0.27	0.00	0.33
10	E1_Da	NovelBoundary	0	15.15	0.00	50.11	0.00	0.00	2.95	0.00
11	E1a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
12	I1	Intron	0	4.02	0.14	18.25	0.36	1.03	0.99	0.12
13	I1_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.42	0.33	11.51	0.00	0.00	0.66	0.00
14	I1_SR2	SilentIntronRegion	0	3.28	0.39	16.97	0.00	0.17	1.16	0.20
15	I1_AR2	ActiveIntronRegion	0	10.19	0.00	28.16	0.00	0.37	3.12	0.31
16	I1_SR3	SilentIntronRegion	0	7.15	0.00	28.20	0.00	0.92	1.39	0.45
17	I1_AR3	ActiveIntronRegion	0	3.81	0.00	19.42	0.73	1.90	0.72	0.08
18	E2_Aa	NovelBoundary	0	3.81	2.84	31.31	1.38	4.40	3.06	0.87
19	ER2a	ExonRegion	0	3.33	0.43	17.25	0.87	3.94	0.65	0.36
20	E2_Da	NovelBoundary	0	1.94	1.47	9.43	1.68	0.00	1.10	0.00
21	E2a_E4a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	6.45	0.00	0.00
22	I2	Intron	0	2.95	0.32	15.52	0.74	0.14	0.56	0.27
23	I2_SR1	SilentIntronRegion	0	5.61	0.00	25.13	0.88	0.00	1.59	0.00
24	I2_AR1	ActiveIntronRegion	0	5.44	0.00	22.94	1.13	0.00	0.65	0.15
25	I2_AR2	ActiveIntronRegion	0	1.51	0.64	13.22	0.45	0.34	0.42	0.49
26	ER3a	ExonRegion	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	1.23	0.00
27	I3	Intron	0	3.91	0.46	18.98	0.41	0.27	0.20	0.25
28	I3_AR1	ActiveIntronRegion	0	4.29	0.67	18.07	0.35	0.48	0.00	0.00
29	I3_SR2	SilentIntronRegion	0	2.91	0.30	17.15	0.47	0.20	0.21	0.26
30	I3_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.31	0.72	24.30	0.00	0.56	0.36	0.11
31	I3_SR3	SilentIntronRegion	0	5.56	0.70	22.38	0.41	0.31	0.20	0.36
32	ER4a	ExonRegion	0	0.60	0.00	1.05	0.00	7.65	1.23	0.00
33	ER4b	ExonRegion	0	3.55	0.09	11.83	0.94	16.38	1.02	0.55
34	E4_Da	KnownBoundary	0	4.04	1.10	9.02	1.65	17.50	0.00	0.89
35	ER4c	ExonRegion	0	1.80	1.21	6.69	0.90	18.51	0.00	0.90
36	E4_Db	NovelBoundary	0	1.92	0.00	16.68	0.00	1.96	0.00	0.00
37	E4b_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	30.11	0.00	0.85
38	I4	Intron	0	5.93	0.55	22.47	1.21	1.06	0.56	0.31
39	I4_AR1	ActiveIntronRegion	0	2.53	0.61	19.51	0.70	1.16	1.40	0.51
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41	I4_AR2	ActiveIntronRegion	0	6.66	0.98	29.03	1.40	2.45	0.78	0.82
42	I4_SR2	SilentIntronRegion	0	5.17	0.00	24.23	0.00	2.15	0.35	0.58
43	I4_AR3	ActiveIntronRegion	0	6.29	0.12	24.45	0.00	2.93	0.63	0.00
44	I4_SR3	SilentIntronRegion	0	7.62	1.09	26.47	0.00	0.67	0.66	0.00
45	I4_AR4	ActiveIntronRegion	0	4.85	0.35	21.19	0.59	0.95	0.43	0.32
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48	I4_SR5	SilentIntronRegion	0	7.51	0.00	28.86	1.18	0.58	0.00	0.53
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69	E5a_E6a	KnownJunction	0	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00
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